发展历史
因为重庆力帆在2003-2010年赛季，七年之中在国内顶级联赛垫底四次，被喻为“垫底王”影响重庆的城市形象。加上2010年赛季结束后，当时有传力帆集团有意撤资力帆队，而重庆市体育局直接接手重庆力帆存在太多麻烦，为推动重庆足球长远发展，摆脱长期低迷的颓势。所以有另一种意见，是让重庆市体育局或重庆足协另起炉灶，成立新的足球俱乐部。正是在这样的背景下，重庆足球俱乐部在2010年12月注册成立。
2011年2月，俱乐部确定由裴恩才担任俱乐部的首任主教练及在全国海选球员，最终确定31人的球员名单参加在同年的乙级联赛，球员名单当中较著名的球员有李思源、万程、邸佑及多名曾效力中超球队及有职业联赛经验的球员。6月6日，裴恩才因联赛成绩欠佳而下课。6月21日，赵发庆成为重庆俱乐部新任主教练。重庆后来居上以南区预赛第二名晋级决赛阶段。11月，球队在半决赛客场击败东莞南城升入中甲联赛，但其后在主场进行的决赛不敌哈尔滨毅腾获得乙级联赛亚军。
球队成绩
2011年11月18日，重庆足球俱乐部冲甲成功。
2012赛季获得中甲联赛第八名。
2013赛季因相互战绩不占优，在与成都同分的情况下，以联赛倒数第二的成绩惨遭降级。
历年赛事
2011年中乙联赛
裴恩才成为2011年中乙联赛下课第一人
2011年6月6日下午三点，中乙球队重庆俱乐部宣布主帅裴恩才下课，裴恩才也成为了2011赛季中乙联赛首位下课的主教练，助理教练员王军也同时离任。
5月8日联赛开始后，球队表现欠佳，比赛成绩不理想，前两轮均以0：1不敌对手，第三轮虽在主场4：0横扫广州青年，但之后客场以0：2不敌福建，第五轮主场对阵湖北队又以1:1被逼平。五轮比赛仅积4分，冲甲形势变得严峻，糟糕的战绩成为了裴恩才提前下课的原因。
有消息称，当初俱乐部和裴恩才签订合同时，一旦前5轮比赛球队拿不到5个积分，裴恩才将被自动解雇。不过这一说法没有得到重庆俱乐部的证实。
赵发庆接任重庆足球俱乐部主帅
2011年6月21日下午，赵发庆出现在训练场边接过重庆足球俱乐部教鞭，正式成为重庆队主教练。
2011年二次转会重足引进三名内援
针对联赛上半程暴露出的问题重庆足球俱乐部在2011年二次转会工作中引进了三名效力中超的实力球员，他们是郑伟、马晓磊和郭明月，其中郑伟效力上海申花此前效力过陕西队在中超表现不俗有过多次助攻是一名组织中场，马晓磊原深圳红钻球员后转会安徽九方可以踢前锋和前卫在中超和中甲都有过进球，郭明月效力于江苏舜天此前效力湖北队可以踢后卫和后腰。
重庆足球俱乐部2011中乙联赛战况：
第一轮5月8日，重庆足球俱乐部0:1东莞南城同舟化工
第二轮5月14日，四川都江堰欣宝1:0重庆足球俱乐部
第三轮5月21日，重庆足球俱乐部4:0广州青年（重庆足球俱乐部取得正式比赛首场胜利，
欧阳雪打进重庆足球俱乐部正式比赛首粒入球）
第四轮5月28日，福建骏豪2:0重庆足球俱乐部
第五轮6月5日，重庆足球俱乐部1:1湖北三大康天
第六轮6月11日，上海中邦2:2重庆足球俱乐部
第七轮6月18日，轮空
第八轮6月25日，重庆足球俱乐部2:2广东青年
第九轮7月2日，湖北青年0:3重庆足球俱乐部（重庆足球俱乐部正式比赛客场首次取得胜利）
第十轮7月9日，重庆足球俱乐部1:0浙江温州葆隆
第十一轮7月31日，四川俱乐部川大0:4重庆足球俱乐部
第十二轮8月6日，东莞南城同舟化工0:1重庆足球俱乐部
第十三轮8月13日，重庆足球俱乐部2:0四川都江堰欣宝
第十四轮8月17日，广州青年1:1重庆足球俱乐部
第十五轮8月21日，重庆足球俱乐部1:0福建骏豪
第十六轮8月27日，湖北三大康天1:1重庆足球俱乐部
第十七轮9月1日，重庆足球俱乐部2:1上海中邦
第十八轮9月5日，轮空
第十九轮9月10日，广东青年1:2重庆足球俱乐部
第二十轮9月15日，重庆足球俱乐部3:2湖北青年
第二十一轮9月20日，浙江温州葆隆2:1重庆足球俱乐部
第二十二轮9月24日，重庆足球俱乐部3:0四川俱乐部川大
中乙复赛阶段：
1/4决赛首回合10月6日：山东男足2：1重庆足球俱乐部
1/4决赛次回合10月10日：重庆足球俱乐部3：1山东男足，经过两回合较量重庆足球俱乐部总比分4：3淘汰山东男足，顺利进入中乙4强，下个对手是东莞南城同舟化工，两回合胜者将进入明年中甲联赛。
半决赛首回合11月14日：重庆足球俱乐部0：0东莞同舟南城
半决赛次回合11月18日：东莞同舟南城0：3重庆足球俱乐部，重庆足球俱乐部进入明年中甲。
中乙总决赛11月24日：重庆足球俱乐部1：1哈尔滨毅腾（点球4：5），重庆足球俱乐部获得2011年中乙亚军并获得2012中甲资格。
2012年中甲联赛
2012赛季名单
主教练：赵发庆
重庆足球俱乐部2012引援状况：
内援：黎斐（原深圳红钻，深圳队队长）、沈龙元（原杭州绿城，国奥球员参加过2008奥运会）、徐擎（原贵州人和）、滕尚坤（原杭州绿城，国青队打过主力门将）、王圣（原抚顺罕王，白金一代国奥队主力，长期效力大连实德队）、崔棋（辽宁宏运二队）
外援：基伦（新西兰人，现役新西兰国家队主力前锋，2010年世界杯新西兰队主力球员）、沃尔特·马丁内斯（洪都拉斯人，2010世界杯洪都拉斯主力球员）、佩雷斯（哥伦比亚人）。
重庆足球俱乐部2012中甲联赛战况：
第一轮3月17日，重庆FC0：2北京理工大学。
第二轮3月24日，广东日之泉1：2重庆FC（王圣打进重庆足球俱乐部中甲联赛上第一球，马晓磊也攻进一球，同时也是重庆足球俱乐部中甲联赛上的首次胜利）。
第三轮3月31日，重庆FC在奥体中心以4：1大胜重庆力帆，取得重庆足球历史上首次同城德比的胜利。马晓磊、欧阳雪、基伦、小马丁内斯各打进一球。
第四轮4月7日，深圳红钻4：2重庆FC，基伦和郭明月进球。重庆FC也遭遇了球队中甲历史上的首次客场失利。
第五轮4月14日，重庆FC1：0沈阳沈北，基伦点球建功。
第六轮4月23日，重庆FC0：0延边长白虎，这也是重庆FC征战中甲联赛中的第一场平局。
第七轮4月29日，重庆FC0：2湖南浏阳河。
第八轮5月5日，北京八喜1：2重庆FC，王圣进球，欧阳雪最后时刻绝杀。
