暴力襲以
成立及名稱演變
2004年11月阿拉法特逝世後，該組織一度改名為“阿拉法特烈士旅”，誓言要繼承阿拉法特遺志，繼續戰鬥。後來，他們又恢複了原名。該組織的宗旨是以武力将以色列從加沙地帶和約旦河西岸地區趕出去，建立一個獨立的巴勒斯坦國。
機構分布
“阿克薩烈士旅”主要力量在納布盧斯和拉馬拉，在西岸其他城市和加沙地帶的難民營裡也有其分部機構。自成立至今，其隊伍一直不斷地在擴大，據巴方透露，該組織現有成員數千人，是一個松散而靈活的軍事組織，沒有統一的指揮首腦，各個地區的“阿克薩烈士旅”組織相對獨立行動，并有行動權，直接負責對以目标的襲擊行動。
攻擊方式和規模
“阿克薩烈士旅”在5年多的巴以暴力沖突中扮演着“主力軍”的角色。最初，他們以以色列士兵和猶太定居點的定居者為主要襲擊目标，頻頻襲擊以色列檢查站，潛入猶太定居點槍殺定居者，伏擊定居點外的行人車輛。但從2002年初開始。“阿克薩烈士旅”逐步走上了進行自殺式爆炸活動的道路。他們持槍在以城市向行人掃射，招募“人彈”進行自殺式爆炸活動，并在2002年1月首先招募巴勒斯坦婦女“人彈”進行自殺式爆炸活動。為其他巴激進組織招募女“人彈”開了先例。
僅在2002年3月，該組織就實施了4次自殺式爆炸事件。此後，被美國列入“恐怖組織名單”。2003年1月份，該組織在特拉維夫外國勞工集中的地段制造了一起連環自殺式爆炸事件，造成22人死亡，100多人受傷，在此事件中，有3名中國勞工被炸身亡，6名中國勞工受傷。
據以方統計，“阿克薩烈士旅”共策劃了300多起暴力襲擊以色列目标（含被以方挫敗，沒有成功的），與“哈馬斯”、“傑哈德”成為制造自殺式爆炸襲以活動的巴三大“主力軍”，而在次數上超過了後兩者。
意識形态
區别
“阿克薩烈士旅”并不是一個極端的伊斯蘭原教旨主義組織，而是一個世俗的民族主義運動組織。它與“哈馬斯”、“傑哈德”等伊斯蘭極端組織的政策有着根本性的不同。“哈馬斯”等極端組織堅持以武力打擊以色列，最終目标是消滅以色列，在約旦河至地中海之間建立一個伊斯蘭的巴勒斯坦國。
“阿克薩烈士旅”的奮鬥目标和以“巴解組織”為主體的巴民族權力機構沒有多大的差别，但在采取什麼手段來實現這些目标存在分歧。巴民族權力機構主張巴以雙方實現停火，執行以美國為首的四方機制拟定的中東和平“路線圖”，盡快與以色列就巴勒斯坦最終地位問題進行談判，欲建立一個民主、獨立的巴勒斯坦國。而“阿克薩烈士旅”則堅持以武裝鬥争的形式來取得最後的勝利。
主張
盡管該組織主張使用武力，但并非要消滅以色列，而且還願意與以色列和平共處。
其領導人表示，如果以色列能接受巴勒斯坦提出的條件，他們願意與以色列實現和平。這些條件包括：以應撤離1967年巴以戰争中以占領的所有巴勒斯坦領土；拆除猶太定居點；釋放所有被關押在以監獄裡的巴勒斯坦人；讓逃離在海外的巴勒斯坦難民擁有“回歸權”。他們不反對在本地區實現兩個國家兩個民族的方案，即一個以東耶路撒冷為首都的阿拉伯人國家和一個以西耶路撒冷為首都的猶太人國家。
無人管束
有關“阿克薩烈士旅”的隸屬問題，以及其是否服從“法塔赫”的指揮，換言之，過去的阿拉法特，阿巴斯能否控制“阿克薩烈士旅”？一直是人們争議的中心。
從“阿克薩烈士旅”成員的組成以及它的宗旨來看，說他們屬于“法塔赫”組織，并沒有太大意見分歧。一名巴官員表示，“阿克薩烈士旅”的大部分成員都有雙重身份，他們既是“阿克薩烈士旅”成員，又可能服役于“法塔赫”所屬的某一個機構，從巴民族權力機構領取薪水。如以軍2002年4月抓捕的“法塔赫”西岸地區總書記馬萬·巴爾古迪，以方稱他是“阿克薩烈士旅”的主要領導人。巴總理庫賴2004年6月曾公開承認，“阿克薩烈士旅”是“法塔赫”的一個組成部分。那麼，既然是“法塔赫”所屬的軍事組織，他們就應聽命于“法塔赫”的領導人。
阿拉法特在世時，他身邊的人曾多次表示，阿拉法特和“法塔赫”并不支持該組織，也無法控制它。而以色列則認為，阿拉法特完全可以控制“阿克薩烈士旅”，隻是他放任該組織。根據以軍繳獲的巴方文件，他們發現了巴民族權力資助“阿克薩烈士旅”2萬美元的一張單據。
該組織領導人之一馬斯拉馬曾對《今日美國報》記者說：“我們是‘法塔赫’的一部分。我們接受‘法塔赫’的指令，阿拉法特就是我們的司令”。但另一個領導人納賽爾對美國《紐約時報》表示：“我們尊重我們的領袖（阿拉法特），但實施襲擊以色列目标行動是由我們自己決定。”他還補充說：“盡管阿拉法特一再譴責自殺式爆炸活動，但他從未直接對‘阿克薩烈士旅’說過要停止自殺式爆炸活動。”
實際上，從“阿克薩烈士旅”所作所為來看，該組織盡管與“法塔赫”有着千絲萬縷的聯系，但基本上排斥了“法塔赫”的領導。它獨自開展襲擊以色列目标行動，甚至多次與“哈馬斯”、“傑哈德”合作進行襲以活動。他們還多次在加沙與拉馬拉示威鬧事，公開與巴民族權力機構“叫闆”，是一匹無人管束的“野馬”。
