曆史沿革
1947年，創建中國人民解放軍第三野戰軍衛生部醫學院。1949年，由華東醫學院、第三野戰軍衛生部醫學院、國防醫學院（部分人員與資源）、華東軍區後勤衛生部醫務幹部輪訓隊合并，組建中國人民解放軍華東軍區人民醫學院。
1949年華東醫務幹部學校創立，1949年9月12日正式開學。
1949年華東醫務幹部學校升格為華東醫學院
1950年10月，更名中國人民解放軍上海軍醫大學。
中國人民解放軍第二軍醫大學
1951年7月9日，更名中國人民解放軍第二軍醫大學。
1955年創立衛勤系。1954年，制定軍醫和藥學專業新的教學計劃和大綱，并完善了辦學體系。
1956年，上海同濟醫院并入。
1960年增設了海醫系。
1961年開始承擔外軍醫學留學生培訓任務。
1969年10月，學校奉命搬遷到西安現第四軍醫大學校址，教學工作完全停止達4年。
1975年8月，學校又奉命遷回上海。
1997年跻身國家“211工程”重點建設院校。
1999年，海軍醫學高等專科學校、海軍411醫院并入。
學校簡介
中國人民解放軍海軍軍醫大學（Naval Medical University），簡稱海軍軍醫大學（第二軍醫大學），國家“211工程”、軍隊“2110工程”和原總後勤部“530工程”重點建設院校，首批國家“世界一流學科建設高校”，軍隊研究生培養重點建設院校，第一批臨床醫學碩士專業學位研究生培養模式改革試點高校，是軍隊3所設置研究生院的單位之一，是全國首批博士、碩士學位授予單位和首批開辦八年制醫學教育的高校，入選教育部“卓越醫生教育培養計劃”、國家建設高水平大學公派研究生項目、國家生命科學與技術人才培養基地、外軍醫學留學生培養基地。
學校是國家“211工程”和軍隊“2110工程”重點建設院校，是軍隊3所設置研究生院的單位之一，是全國11所開辦八年制醫學教育的院校之一，是36個“國家生命科學與技術人才培養基地”之一，是我軍唯一的外軍醫學留學生培訓基地。
學術研究
科研機構
學校有國家重點實驗室1個，教育部重點實驗室2個，衛生部重點實驗室1個，上海市重點實驗室3個，擁有全軍重點實驗室10個，其中免疫與基因治療實驗室、生物信号轉導實驗室和藥物化學實驗室被評為全軍“重中之重”重點建設實驗室。
科研成果
截止2013年，三年期間，學校承擔國家“863”、“973”等重點項目140多項，各類課題3200餘項，經費總額13.9億元。學校先後獲得國家最高科學技術獎1項、國家科技進步一等獎2項、國家自然科學獎二等獎4項，國家技術發明獎二等獎5項，國家科技進步獎二等獎32項，省部級二等獎以上成果600餘項。
學術期刊
《第二軍醫大學學報》：中文核心期刊，CA化學文摘、JST日本科學技術振興機構數據庫、Pж(AJ)收錄期刊。
《解放軍護理雜志》：中國科技核心期刊、中國科技論文統計源期刊。
《Journal of Integrative Medicine》
《藥學實踐》
辦學規模
學校設有“四部二院”，下轄“一部八系”，開設臨床醫學、海軍臨床醫學、藥學、公共衛生事業管理、護理學等13個。
學科建設
截止2013年，學校有國家級重點學科一級學科2個，二、三級學科26個，上海市重點學科7個，軍隊“2110工程”重點建設學科3個，總後“530工程”重點建設學科5個。基礎醫學、臨床醫學、中西醫結合、藥學、特種醫學、護理學、公共管理等7個學科列入上海高校一流學科建設計劃。擁有博士學位授權一級學科10個，二、三級學科83個，碩士學位授權一級學科20個，二、三級學科106個，博士後流動站7個。
一級學科博士學位授權點：
生物學、基礎醫學、臨床醫學、公共衛生與預防醫學、中西醫結合、藥學、中藥學、護理學、特種醫學、公共管理。
一級學科碩士學位授權點：
馬克思主義理論、化學、心理學、教育學、外國語言文學、中醫學、軍事後勤學、圖書館情報與檔案管理、生物醫學工程、計算機科學與技術、生物學、基礎醫學、臨床醫學、公共衛生與預防醫學、中西醫結合、藥學、中藥學、護理學、特種醫學、公共管理。
專業碩士學位授權點：
臨床醫學碩士、口腔醫學碩士、公共衛生碩士、護理碩士、藥學碩士、公共管理碩士。
師資力量
實施了“5511”人才建設工程，全面推行科室主任聘任制。科技幹部隊伍中，有兩院院士4名（中科院院士：吳孟超、陳宜張，工程院院士：曹雪濤、王紅陽），“長江學者獎勵計劃”特聘教授4名（曹雪濤、王紅陽、夏照帆、何成）、“973”首席科學家3名（曹雪濤、郭亞軍、潘衛慶），榮獲全軍專業技術重大貢獻獎和軍隊專業技術人才獎4人（吳孟超、廖萬清、曹雪濤、李兆申），國家有突出貢獻中青年專家6名（戚中田、朱明學、張寶仁、廖萬清、賈連順、侯春林）、“百千萬人才工程”國家級人選5名（曹雪濤、戚中田、何成、夏照帆、楊甲梅）、“中國青年科技獎”5名（曹雪濤、何成、章衛平、蔣春雷、張衛東）、總後“三星”人才41名、一代名師和伯樂獎22名，上海市醫學領軍人物9名。博士生導師184名，碩士生導師414名。
科技創新
學校積極推進科研管理體制改革和機制創新，加強重大、重點項目的研究和聯合攻關，着力活躍學術氛圍，促進了科研規模、水平、效益的持續發展。近三年，學校共承擔各類縱向科研課題653項，經費2.1億多元。其中，承擔國家自然科學基金面上項目270項，重點、重大項目6項。共獲軍隊級（含省部級）以上科技成果獎共196項。其中國家最高科學技術獎1項，國家自然科學二等獎1項，國家技術發明二等獎1項，國家科技進步二等獎2項，上海市自然科學一等獎1項，上海市科技進步一等獎6項，軍隊醫療成果獎一等獎5項，中華醫學科技一等獎1項，上海市醫學科技一等獎4項，軍隊科技進步二、三等獎36項，軍隊醫療成果二、三等獎70項。
合作交流
學校長海醫院和新加坡中央醫院簽有合作協議，将重點在管理幹部培訓、護理骨幹業務深造及住院醫師規範化培訓等領域開展交流合作。學校醫學免疫學國家重點實驗室和香港大學醫學轉化免疫學實驗室建有合作關系；與香港中文大學簽署了《第二軍醫大學與香港中文大學合作備忘錄》，就兩校在醫學教育、人才培養、學科建設和醫學研究等多方面開展合作達成了共識；2009年3月，與瑞典哥德堡大學薩爾格倫斯卡醫學院簽署了校際合作協議；2010年6月與澳大利亞昆士蘭大學簽署了學生交流與科研合作協議。
文化傳統
校訓
求實創新 嚴謹獻身
校徽
校徽中間是傳統意義上指代醫學的赫爾墨斯蛇杖，蛇杖上方的五角星指明了學校的軍校性質，下方的大錨則突出了學校在海醫領域的特色和優勢。
校歌
遙望吳淞口的船影傾聽黃浦江的濤聲
繁花綠葉擁抱着校園
中國人民解放軍第二軍醫大學校歌
醫學戰線桃李滿軍營
求實創新嚴謹獻身
多彩的理想照亮一生
這裡青春開花的地方
奉獻中有我們錦繡前程
這裡青春開花的地方
奉獻中有我們錦繡前程
軍旗在彩霞裡飄動
陳毅元帥書寫光輝校名
前輩用心血培育了我們
我們高高托起醫學彩虹
救死扶傷服務軍民
戎裝披雪繼續長征
我們和軍校展翅同飛
跟着祖國太陽一起上升
我們和軍校展翅同飛
跟着祖國太陽一起上升
附屬醫院
第一附屬醫院
第二軍醫大學長海醫院是一所集醫療、教學、科研為一體的現代化大型綜合性三級甲等醫院。醫院布局合理，環境優美，擁有現代化的病房大樓、醫技樓、門急診樓、科技樓、教學辦公樓、影像診斷中心樓、感染科樓、康賓樓、制劑樓等醫療建築群。醫院現有49個科室，工作人員2700餘名，其中高級職稱250餘人。年門急診量130萬餘人次，收治病人3.5萬餘人次，展開床位1500餘張。設有臨床醫學博士後流動站，25個博士點，40個碩士點。每年完成臨床醫學、海軍臨床醫學、藥學、衛生事業管理、護理等專業和外國留學生共30餘個班次3000多名學員的教學任務。
先後形成了肝膽外科、胸心外科、燒傷外科、血液内科、消化内科等特色學科。目前有普外、骨科、燒傷、胸心、中西醫結合臨床、影像醫學、消化醫學7個國家級重點學科；擁有全軍專科研究所、中心6個，全軍重點實驗室2個、上海市領先專業重點學科2個、示範學科1個，是全國、全軍臨床藥理基地。
醫院現有儀器設備總價值達3.7億元人民币，1999年榮獲“全國百佳醫院”稱号。
第二附屬醫院
第二軍醫大學長征醫院學科齊全、設備先進，是集醫療、教學、科研為一體的綜合性三級甲等醫院。設有22個博士點，30個碩士點，是臨床博士後流動站單位。現有高級專業技術職務人員200餘名，其中博士生導師40名，碩士生導師79名，國家有突出貢獻的中青年專家6名，享受政府特殊津貼專家54名，30餘名專家在國家、軍隊學術組織任職。
醫院醫療儀器先進，設備齊全，擁有CT、磁共振(MRI)、數字減影儀(DSA)、核素掃描儀(ECT)、各種纖維内窺鏡、彩色多普勒超聲儀等，有國際一流的全淨化手術室、層流病房和重症監護中心。醫療儀器設備總資産達3.5億餘元。醫院學科門類齊全，設有臨床科室24個、醫技科室9個、教研室17個、實驗室25個、7個全軍專業技術中心和研究所，展開床位1000張，普外、骨科、胸心、中西醫結合臨床、影像醫學、器官移植、消化醫學為國家重點建設學科。
第三附屬醫院
第二軍醫大學東方肝膽外科醫院是國内外首家集醫療、教學、科研為一體的肝膽外科醫院和肝膽外科研究所，是該校第三臨床附屬醫院，國家級重點建設學科、博士後流動站。1996年9月正式建院，同年被評為“三級甲等”專科醫院。
醫院設有特需診療科、肝外一科、肝外二科、腹腔鏡病區、膽道外科等15個臨床科室和實驗診斷科等10個醫技科室，展開病床660張。設有中美合作腫瘤免疫和基因治療中心、中日合作内窺鏡治療中心、中德合作生物信号傳導研究中心以及肝髒移植中心。
醫院先後獲軍隊科技進步二等獎以上成果17項。
長征醫院南京分院
二軍大長征醫院南京分院是一所集醫療、科研教學為一體，專科齊全，設備和先進，技術水平精湛的綜合性醫院。1998年被軍區總部授于“三級甲等醫院”，江蘇科研先進單位，是解放軍醫學院，江蘇中醫學院和等院校的實習基地，醫院現有專業技術人員400餘名，擁有床位500餘張，同時是江蘇省醫保定點單位，同時并于2003年全院進入“軍字一号”網絡管理系統。
