學院簡介
1966年，學校停止招收研究生。1978年學校被确定為全國重點大學，同年恢複研究生招生，并在艦艇結構力學等學科首批招收8名碩士研究生，成為文革後第一批開展研究生教育的大學之一。1981年，學校被國務院批準為首批博士、碩士學位授權單位，船舶流體力學、水聲工程2個學科獲得首批博士學位授予權。1997年，學校開始招收全國第一批工程碩士研究生。當年，學校研究生總數達1759人，研究生導師257人。
2002年，教育部批準學校設立研究生院，成為全國56所設有研究生院的高校之一，學校進入國家研究生培養主力軍行列。2007年獲準建立研究生院。2009年，學校通過工信部“研究生教育優秀工程”專家組現場評估驗收并獲優秀評價。
目前，研究生院下設院辦、招生辦、培養辦、學位辦、學術辦5個科室。副校長吳林志兼任研究生院院長。目前，哈爾濱工程大學有國家級重點學科2個，博士學位授予權一級學科12個，一級學科碩士點29個；國家重點學科一級1個、二級1個，國防特色學科11個，黑龍江省重點學科群1個。
在學科門類和招生類型上，學校可在經濟學、法學、教育學、文學、理學、工學、管理學、藝術學等8個門類招收碩士研究生，在工學、法學、管理學等3個學科門類招收博士研究生，并可招收工程碩士、工商管理碩士（含EMBA）、公共管理碩士、金融碩士、翻譯碩士、社會工作等6種專業學位碩士研究生，形成了支撐學校高層次創新人才培養的學位授權體系。
截至2016年12月，學校各類在校研究生總數為8123人，其中博士生1775人，碩士生5812人，留學研究生300人。如今，學校的博士生導師從首批批準的2人已經發展到今天的477人，形成了一支以兩院院士、長江學者等國内外知名專家為引領，全國優秀教師，教育部跨世紀優秀人才等學科帶頭人為中堅的研究生導師隊伍。高水平的導師團隊帶動了重點實驗室和研究生實踐基地的建設。
目前學校有國家級重點實驗室2個，教育部重點實驗室及工程研究中心5個，國防重點學科實驗室2個，省重點實驗室及工程研究中心5個，省發改委工程實驗室3個。學校與中船重工703研究所、中國電子科技集團第49研究所等單位聯合建立了6個省級研究生培養創新示範基地，與國内衆多大中型企業建立了産學研聯合培養研究基地，為研究生開展社會實踐實習搭建了良好的創新能力培養平台。
我校與中國船舶重工集團公司第703研究所聯合培養研究生實踐基地獲評“全國示範性工程專業學位研究生聯合培養基地”。作為行業特色型高校，2011年，學校入選首批“全國工程碩士研究生教育創新院校”，成為全國50所創新院校之一，同時船舶與海洋工程、控制工程、核能與核技術3個工程領域入選“全國工程碩士研究生教育特色工程領域”。
學校成為國家留學基金委“建設高水平大學公派研究生項目簽約高校”，比利時布魯塞爾自由大學聯合培養博士生項目、俄羅斯遠東聯邦大學聯合培養研究生項目、船舶與海洋工程人才培養項目入選“國家創新型人才國際合作培養項目”。《随機過程》《聲學測量》《核反應堆工程》《現代設計方法》入選教育部“來華留學英語授課品牌課程”。2門課程入選全國工程專業學位教指委研究生教育在線課程重大建設項目。
近年來，學校堅持“三海一核”特色辦學方略，全面推進“創新推動，打造品牌”的人才培養戰略，研究生教育取得了明顯進步和發展，辦學規模不斷擴大，為國家和社會培養了多門類高層次專門人才。從2003年至今，學校共培養碩士、博士以及各類專業學位碩士3萬餘名，研究生畢業生就業率連續多年保持在95%以上，每年海軍、船舶、核工業系統等幾百家用人單位專程到我校招聘畢業生，使我校畢業生在激烈的就業競争中具備了特色的優勢和競争力。
哈爾濱工程大學研究生教育始終堅持以“提高質量”為核心，全面落實學校綜合改革，以“十三五”規劃為指導，不斷深化研究生培養機制改革，全面提高研究生培養質量。
自研究生院成立的10餘年來，哈爾濱工程大學步入了研究生學位教育速度、規模到質量大幅提升的跨越期。全校對“研究生教育對學校創建高水平研究型大學具有重要的先導性、全局性和戰略性地位，是學校事業發展最核心、最重要的組成部分之一”達成共識，形成了通力為研究生教育服務的氛圍，促進了研究生教育水平不斷提升，為學校創建特色鮮明的高水平研究型大學注入了強勁的發展動力，我們相信，随着學校綜合改革的推進，學校将會為我國建設海洋強國培養更多可靠頂用的人才。
現任領導和分工
組織機構
院辦公室
1.研究生院日常行政管理
2.研究生教育教學改革研究工作
3.研究生教育數據統計和信息管理工作
4.研究生院網站建設
招生辦公室
1.制訂研究生年度招生計劃，編制招生簡章和專業目錄
2.組織開展研究生招生宣傳與咨詢工作
3.組織開展國家研究生入學考試哈爾濱工程大學考點建設與考試組織實施工作，組織開展招生自命題與閱卷工作
4.組織開展研究生招生報名、考試、調劑、複試、錄取工作
5.組織開展推免生接收、直博生和碩博連讀生選拔工作
6.組織開展博士生導師招生計劃年度申報工作
7.組織開展申請考核制博士生招生工作
8.組織開展新生入學資格審查和花名冊制作工作
9.負責研究生招生機制體制改革、招生工作實踐的總結、分析與數據上報(公布)工作
培養工作辦公室
1.研究生培養方案制定及管理
2.研究生課程建設
3.研究生教材建設
4.專業學位研究生實習實踐基地建設及管理
5.研究生課程運行管理（課程安排、課程開設及取消、任課教師、課程考核、成績管理）
6.研究生教學質量管理
學位工作辦公室
1.研究生（含外國留學生）學位授予管理
2.研究生開題及學期檢查管理
3.研究生畢業注冊、學位注冊及圖像信息采集
4.外校學位論文評閱受理
5.導師遴選、評價及日常管理工作
6.校學位評定委員會辦公室的日常管理工作
7.學術和專業學位點的動态調整、自評估和評估工作
8.質量評價與保障體系建設
學術工作辦公室
1.研究生學籍管理
2.各類獎助學金評審與發放
3.評獎評優
4.組織開展研究生各類學術科技活動
5.創新實踐競賽活動及學術文化建設
6.校外基地建設
教學設施
學校占地總面積125萬平方米，建築面積93萬平方米。校園環境優美，綠樹成蔭，建築風格中西合璧，飛檐碧瓦，氣勢恢宏。現設有15個二級學院，3個教學系（部）。學校設有40多個科研機構以及150多個科研和教學實驗室，其中國防科技重點實驗室2個，國防重點學科實驗室2個，國家級學科創新引智基地2個，國家電工電子教學基地1個，國家級實驗教學示範中心4個，國家大學生文化素質教育基地1個。圖書館共有藏書270餘萬冊。
師資力量
學校現有教職工3199人，其中專任教師1806人，教授392人，副教授484人。教師中有“兩院”院士9人（含雙聘6人），博士生導師298人，享受政府特殊津貼專家109人，國家級有突出貢獻中青年專家5人，“長江學者獎勵計劃”特聘教授、講座教授4人，教育部“新世紀優秀人才支持計劃”入選者14人。
學校注重教學研究工作，近年來獲國家及省部級優秀教學成果獎150多項；我校共有3篇博士論文入選“全國百篇優秀博士學位論文”。學校被教育部、解放軍總政治部列入“21世紀人才強軍計劃”，并成為海軍在的東北地區唯一一所選拔培養後備軍官依托院校。
