校史
1994年10月“慈濟醫學院”創校。
1998年8月更名為“慈濟醫學暨人文社會學院”。
2000年8月改名為“慈濟大學”，包括醫學院、生命科學院、人文社會學院及教育傳播學院。
2000年“慈濟大學附屬高級中學”及“慈濟大學實驗國民小學”正式創校。
2002年“慈濟大學實驗國民小學附設幼稚園”創校。
2007年9月新增人文社會學院校區。
2011年8月“慈濟大學附屬高級中學”及“慈濟大學實驗國民小學”合并為“慈濟大學附屬高級中學”（含高中高、國中部、國小部、附設幼稚園）
2011年10月校名更名為“慈濟學校财團法人慈濟大學”。
教學研究單位
醫學類
醫學系
醫學研究所
護理學系暨研究所
公共衛生學系暨研究所
醫學檢驗生物技術學系暨研究所
醫學資訊學系暨研究所
微免暨生物化學研究所
生理暨解剖醫學研究所
臨床醫學研究所
藥理暨毒理學研究所
物理治療系
學士後中醫學系
生命科學院
生命科學系暨研究所
分子生物暨人類遺傳學系暨研究所
教育傳播學院
教育研究所
傳播學系暨研究所
兒童發展與家庭教育學系
師資培育中心
人文社會學院（介仁校區）
宗教與人文研究所
社會工作學系暨研究所
人類發展學系暨研究所
英美語文學系
東方語文學系
社會地位
慈大的學門發展主軸明确，即醫學、生命科學、社會人文、教育傳播四大領域，在中國台灣各具其影響力。并擁有中國台灣唯一的：傳播學系具有大愛電視台輔助的教學見實習系所。
迄2012年，慈大姊妹校已包括中國大陸名校北京大學、上海交通大學、中山大學；港澳名校香港大學；歐美名校伯克利大學；東南亞名校馬來亞、朱拉隆功等。
慈濟大學校訓
慈悲喜舍
學術獨立
慈濟大學雖由佛教慈善團體創立，但教職員生仍享有中國台灣“憲法”第十三條所保障之宗教自由，學生社團亦有聖經真理生命社、儒學社、觸愛團契等，現全校絕大多數皆非慈濟人。
研究中心
原住民健康研究室
運動員藥檢中心
古人類DNA研究室
實驗動物中心
自主神經研究室
社團活動
目前共有6個大類：“學生自治組織”、“學術、藝術性”、“服務性”、“音樂性”、“聯誼性”、“體育性”，2010年底共計56個學生社團，其中不乏表現優異者（僅計入日間部登記在案者，不含校隊、進修部、各系學會下屬校隊社團）。
國樂社：“九十五學年度學生音樂比賽-大專團體組絲竹室内樂合奏”優等第一名
合唱團：“2007大專院校音樂比賽北區優等”
慈青社、天文社：“2007年大專校院績優學生社團評鑒暨觀摩活動”優等獎
曆任校長
1993年02月至2000年05月第一任李明亮（前中國台灣“行政院”衛生署署長）
2001年03月至2002年07月第二任藍忠孚
2002年12月至2005年11月第三任方菊雄
2006年03月至今第四任王本榮
附屬學校
附屬中學：慈濟大學附屬高級中學
附屬中學國小部與幼稚園：慈濟大學附屬高級中學國小部（附設幼稚園）
教育與研究
進入ESI學門排名
高等教育評鑒中心公布國内大學ESI學門排名（2009.05），全中國台灣171所大學僅31校進入ESI學門排名，進入ESI排名即表示進入世界前1%。慈濟大學進入ESI全球排名之學門有以下一門。
進入WOS排名全台前15大
依據中國台灣“财團法人高等教育評鑒中心基金會”公布的2004年至2009年WOS（Web of Science）收錄SCI期刊當中各學門論文數與被引次數表現在中國台灣前15的學校名單統計，慈濟大學一共有6個學門列入前15名，其中4個學門在IF平均積分項目上列入前五名。其中“期刊影響系數（IF）”平均積分統計結果，神經科學與行為學IF平均積分排名第2，臨床醫學學門IF平均積分台灣排名第2，精神病學與心理學門IF平均積分中國台灣排名第3。
教研成果
企業最愛畢業生
依據《Cheers快樂工作人雜志》的“2008年中國台灣1000大企業最愛大學畢業生”調查顯示，慈大“生命科學院”排名第5名，僅次于台大、清大、成大及陽明。
醫學院國考合格率
2006年醫師高考及格率96%（中國台灣平均及格率72.10%），護理師高考89.2%（中國台灣平均及格率31.42%），醫檢師（73.17%中國台灣平均及格率41.36%）。醫學院“國考”及格率年年優于平均值外，其中數年更居于中國台灣及格率榜首
2002第二階段87%優于整體平均71%
2002高考31%優于整體平均18%
2003第二階段100%優于整體平均70%（榜首）
2003高考85%優于整體平均48%
2004高考90%優于整體平均66%
2005高考91%優于整體平均73%
2006高考96%優于整體平均72%
2007醫師（二）100%優于整體平均98%（并列榜首）
2007醫師（一）82%優于整體平均59%（榜首）
2007醫師85%優于整體平均50%
教學卓越計劃
在中國台灣“教育部”95、96學年度“教育部補助重要特色領域人才培育改進計劃”當中，慈大獲得新台币近3000萬元的補助，總額在33所獲款大學中為中國台灣第8名。
大學新生注冊率
96學年度大學部注冊率92.25%（95年為90.43%），研究所注冊率92.77%，遠優于平均值82%。
高教評鑒通過率
評鑒年度為：98學年度下，與台灣大學、台北大學、中正大學同期評鑒，評鑒結果除兩研究所新增設仍待觀察外，其餘系所全數通過。
私校體育評鑒獲“一等”
交通
校本部校區
位于花蓮市中央路三段與莊敬路交叉口，鄰近有花蓮車站及花蓮機場。
人文社會學院校區
位于花蓮市介仁街上，大門對面為慈濟大學附屬高級中學（國小部）大門，臨近碧雲莊社區、達固湖灣大路。
宿舍
校本部校區
為四人一間，房内有衛浴設備。
公共設施：各層有室内曬衣場（洗衣機、脫水機）、簡易廚房、讀書室，并有戶外大曬衣場，舍外有機車停車場。
人文社會學院校區
為四人一間，房内有衛浴設備，室内外曬衣陽台。
公共設施：販賣機、公用大冰箱、洗衣間（ㄧ間）、簡易廚房（冰箱、電鍋、電視、沙發組）、自修室，靠近達固湖灣大路，設有戶外汽機車停車場（機車有遮棚）。
餐廳
校本部校區
校内餐廳提供低廉價格的早中晚餐素食，校外即有7-11及各式餐廳、便當。
人文社會學院校區
校内餐廳提供低廉價格的早午晚餐素食，周六日休息，但有提供訂餐服務。
校外餐飲需步行（十分鐘左右）至介仁街與建國路二段交叉口，有餐廳、便當店、飲料店、便利商店、市場（早）。
