历史沿革
1906年，原镇江南站随沪宁铁路开通，时名镇江旗站。车站设有总面积3046平方呎（约合282.8平方米）的站房6座和111.4平方米的办事员住所6间，办理客货运业务。
1935年，车站改为镇江南站，为客货运五等站。
1949年后，车站等级上升为四等站。
1976年，车站停办客运业务。
2011年5月17日，经中华人民共和国铁道部批准，正式将京沪高速铁路镇江西站命名为镇江南站，原镇江南站更名为镇江东站。
2008年4月18日，车站开工建设，时称镇江西站。
2011年5月17日，经中华人民共和国铁道部批准，正式将京沪高速铁路镇江西站命名为镇江南站，原镇江南站更名为镇江东站。
2011年6月30日，伴随京沪高速铁路开通运营，镇江南站投入使用。
2018年7月1日，镇江南站开行长编组“复兴号”列车。12月15日，镇江南站优化提升工程开工。
2019年11月26日，镇江南站启用电子客票。
建筑规模
建筑设计
镇江南站的设计风格为银白色的圆弧状屋顶，主色调采用淡蓝色和灰色混合的江水色；站房设计引入了江涛、江浪纹和山石纹，以体现地域文化———镇江三面环山，一面临江，截至2011年6月，镇江南站站房建筑面积5993平方米。
整体布局
镇江南站站房分作两层：一层候车站厅，二层有两个站台。候车站厅南北通透，各设一个出入口。站厅位于铁路高架桥正下方，利用数个桥墩之间的空隙建造。出站口位于站房西侧，楼梯从站台直接引下。
截至2019年5月，镇江南站设有两个售票厅，位于候车室东侧，各设有4个人工售票窗口，北面售票厅设6台自动售票售票机，南面售票厅设2台自动售票机。镇江南站采用线下候车结构，设有300个候车座位、4个检票口：候车室东侧设有B1、B2检票口，西侧设有A1、A2检票口，通往高架二层的四个站台。车站出站口位于候车室西侧，有两组楼梯连接两座高架岛式站台。出站口设6个出站通道，其中窄通道4个，宽通道1个，人工通道1个。
站台线路
截至2011年6月，镇江南站站场规模为2台6线，其中正线2条，到发线4条；站台为双岛式，站台层标高为13.75米，途经线路是京沪高速铁路。
运营情况
自助购票
镇江南站一层候车大厅售票处在大厅两侧，同时设立了人工售票处和自动售票机，其中，北面售票厅设6台自动售票售票机，南面售票厅设2台自动售票机（截至2019年5月）。
便民设施
镇江南站为了方便携带大宗行李的乘客或残疾人通行，在广场两侧设立了带有扶手的回廊坡道。
客运流量
2012年4月1日，镇江南站上车旅客达到2001人，下车旅客有2473人。
截至2017年12月，镇江南站日均人流量增加至1.2万人次（高峰时达到1.8万人次）。
价值意义
随着京沪高速铁路的正式开通运营，镇江南站的建成，有力推动了镇江经济社会的发展，也给百姓的出行带来了更大的便利。
