历史沿革
1947年，创建中国人民解放军第三野战军卫生部医学院。1949年，由华东医学院、第三野战军卫生部医学院、国防医学院（部分人员与资源）、华东军区后勤卫生部医务干部轮训队合并，组建中国人民解放军华东军区人民医学院。
1949年华东医务干部学校创立，1949年9月12日正式开学。
1949年华东医务干部学校升格为华东医学院
1950年10月，更名中国人民解放军上海军医大学。
中国人民解放军第二军医大学
1951年7月9日，更名中国人民解放军第二军医大学。
1955年创立卫勤系。1954年，制定军医和药学专业新的教学计划和大纲，并完善了办学体系。
1956年，上海同济医院并入。
1960年增设了海医系。
1961年开始承担外军医学留学生培训任务。
1969年10月，学校奉命搬迁到西安现第四军医大学校址，教学工作完全停止达4年。
1975年8月，学校又奉命迁回上海。
1997年跻身国家“211工程”重点建设院校。
1999年，海军医学高等专科学校、海军411医院并入。
学校简介
中国人民解放军海军军医大学（Naval Medical University），简称海军军医大学（第二军医大学），国家“211工程”、军队“2110工程”和原总后勤部“530工程”重点建设院校，首批国家“世界一流学科建设高校”，军队研究生培养重点建设院校，第一批临床医学硕士专业学位研究生培养模式改革试点高校，是军队3所设置研究生院的单位之一，是全国首批博士、硕士学位授予单位和首批开办八年制医学教育的高校，入选教育部“卓越医生教育培养计划”、国家建设高水平大学公派研究生项目、国家生命科学与技术人才培养基地、外军医学留学生培养基地。
学校是国家“211工程”和军队“2110工程”重点建设院校，是军队3所设置研究生院的单位之一，是全国11所开办八年制医学教育的院校之一，是36个“国家生命科学与技术人才培养基地”之一，是我军唯一的外军医学留学生培训基地。
学术研究
科研机构
学校有国家重点实验室1个，教育部重点实验室2个，卫生部重点实验室1个，上海市重点实验室3个，拥有全军重点实验室10个，其中免疫与基因治疗实验室、生物信号转导实验室和药物化学实验室被评为全军“重中之重”重点建设实验室。
科研成果
截止2013年，三年期间，学校承担国家“863”、“973”等重点项目140多项，各类课题3200余项，经费总额13.9亿元。学校先后获得国家最高科学技术奖1项、国家科技进步一等奖2项、国家自然科学奖二等奖4项，国家技术发明奖二等奖5项，国家科技进步奖二等奖32项，省部级二等奖以上成果600余项。
学术期刊
《第二军医大学学报》：中文核心期刊，CA化学文摘、JST日本科学技术振兴机构数据库、Pж(AJ)收录期刊。
《解放军护理杂志》：中国科技核心期刊、中国科技论文统计源期刊。
《Journal of Integrative Medicine》
《药学实践》
办学规模
学校设有“四部二院”，下辖“一部八系”，开设临床医学、海军临床医学、药学、公共卫生事业管理、护理学等13个。
学科建设
截止2013年，学校有国家级重点学科一级学科2个，二、三级学科26个，上海市重点学科7个，军队“2110工程”重点建设学科3个，总后“530工程”重点建设学科5个。基础医学、临床医学、中西医结合、药学、特种医学、护理学、公共管理等7个学科列入上海高校一流学科建设计划。拥有博士学位授权一级学科10个，二、三级学科83个，硕士学位授权一级学科20个，二、三级学科106个，博士后流动站7个。
一级学科博士学位授权点：
生物学、基础医学、临床医学、公共卫生与预防医学、中西医结合、药学、中药学、护理学、特种医学、公共管理。
一级学科硕士学位授权点：
马克思主义理论、化学、心理学、教育学、外国语言文学、中医学、军事后勤学、图书馆情报与档案管理、生物医学工程、计算机科学与技术、生物学、基础医学、临床医学、公共卫生与预防医学、中西医结合、药学、中药学、护理学、特种医学、公共管理。
专业硕士学位授权点：
临床医学硕士、口腔医学硕士、公共卫生硕士、护理硕士、药学硕士、公共管理硕士。
师资力量
实施了“5511”人才建设工程，全面推行科室主任聘任制。科技干部队伍中，有两院院士4名（中科院院士：吴孟超、陈宜张，工程院院士：曹雪涛、王红阳），“长江学者奖励计划”特聘教授4名（曹雪涛、王红阳、夏照帆、何成）、“973”首席科学家3名（曹雪涛、郭亚军、潘卫庆），荣获全军专业技术重大贡献奖和军队专业技术人才奖4人（吴孟超、廖万清、曹雪涛、李兆申），国家有突出贡献中青年专家6名（戚中田、朱明学、张宝仁、廖万清、贾连顺、侯春林）、“百千万人才工程”国家级人选5名（曹雪涛、戚中田、何成、夏照帆、杨甲梅）、“中国青年科技奖”5名（曹雪涛、何成、章卫平、蒋春雷、张卫东）、总后“三星”人才41名、一代名师和伯乐奖22名，上海市医学领军人物9名。博士生导师184名，硕士生导师414名。
科技创新
学校积极推进科研管理体制改革和机制创新，加强重大、重点项目的研究和联合攻关，着力活跃学术氛围，促进了科研规模、水平、效益的持续发展。近三年，学校共承担各类纵向科研课题653项，经费2.1亿多元。其中，承担国家自然科学基金面上项目270项，重点、重大项目6项。共获军队级（含省部级）以上科技成果奖共196项。其中国家最高科学技术奖1项，国家自然科学二等奖1项，国家技术发明二等奖1项，国家科技进步二等奖2项，上海市自然科学一等奖1项，上海市科技进步一等奖6项，军队医疗成果奖一等奖5项，中华医学科技一等奖1项，上海市医学科技一等奖4项，军队科技进步二、三等奖36项，军队医疗成果二、三等奖70项。
合作交流
学校长海医院和新加坡中央医院签有合作协议，将重点在管理干部培训、护理骨干业务深造及住院医师规范化培训等领域开展交流合作。学校医学免疫学国家重点实验室和香港大学医学转化免疫学实验室建有合作关系；与香港中文大学签署了《第二军医大学与香港中文大学合作备忘录》，就两校在医学教育、人才培养、学科建设和医学研究等多方面开展合作达成了共识；2009年3月，与瑞典哥德堡大学萨尔格伦斯卡医学院签署了校际合作协议；2010年6月与澳大利亚昆士兰大学签署了学生交流与科研合作协议。
文化传统
校训
求实创新 严谨献身
校徽
校徽中间是传统意义上指代医学的赫尔墨斯蛇杖，蛇杖上方的五角星指明了学校的军校性质，下方的大锚则突出了学校在海医领域的特色和优势。
校歌
遥望吴淞口的船影倾听黄浦江的涛声
繁花绿叶拥抱着校园
中国人民解放军第二军医大学校歌
医学战线桃李满军营
求实创新严谨献身
多彩的理想照亮一生
这里青春开花的地方
奉献中有我们锦绣前程
这里青春开花的地方
奉献中有我们锦绣前程
军旗在彩霞里飘动
陈毅元帅书写光辉校名
前辈用心血培育了我们
我们高高托起医学彩虹
救死扶伤服务军民
戎装披雪继续长征
我们和军校展翅同飞
跟着祖国太阳一起上升
我们和军校展翅同飞
跟着祖国太阳一起上升
附属医院
第一附属医院
第二军医大学长海医院是一所集医疗、教学、科研为一体的现代化大型综合性三级甲等医院。医院布局合理，环境优美，拥有现代化的病房大楼、医技楼、门急诊楼、科技楼、教学办公楼、影像诊断中心楼、感染科楼、康宾楼、制剂楼等医疗建筑群。医院现有49个科室，工作人员2700余名，其中高级职称250余人。年门急诊量130万余人次，收治病人3.5万余人次，展开床位1500余张。设有临床医学博士后流动站，25个博士点，40个硕士点。每年完成临床医学、海军临床医学、药学、卫生事业管理、护理等专业和外国留学生共30余个班次3000多名学员的教学任务。
先后形成了肝胆外科、胸心外科、烧伤外科、血液内科、消化内科等特色学科。目前有普外、骨科、烧伤、胸心、中西医结合临床、影像医学、消化医学7个国家级重点学科；拥有全军专科研究所、中心6个，全军重点实验室2个、上海市领先专业重点学科2个、示范学科1个，是全国、全军临床药理基地。
医院现有仪器设备总价值达3.7亿元人民币，1999年荣获“全国百佳医院”称号。
第二附属医院
第二军医大学长征医院学科齐全、设备先进，是集医疗、教学、科研为一体的综合性三级甲等医院。设有22个博士点，30个硕士点，是临床博士后流动站单位。现有高级专业技术职务人员200余名，其中博士生导师40名，硕士生导师79名，国家有突出贡献的中青年专家6名，享受政府特殊津贴专家54名，30余名专家在国家、军队学术组织任职。
医院医疗仪器先进，设备齐全，拥有CT、磁共振(MRI)、数字减影仪(DSA)、核素扫描仪(ECT)、各种纤维内窥镜、彩色多普勒超声仪等，有国际一流的全净化手术室、层流病房和重症监护中心。医疗仪器设备总资产达3.5亿余元。医院学科门类齐全，设有临床科室24个、医技科室9个、教研室17个、实验室25个、7个全军专业技术中心和研究所，展开床位1000张，普外、骨科、胸心、中西医结合临床、影像医学、器官移植、消化医学为国家重点建设学科。
第三附属医院
第二军医大学东方肝胆外科医院是国内外首家集医疗、教学、科研为一体的肝胆外科医院和肝胆外科研究所，是该校第三临床附属医院，国家级重点建设学科、博士后流动站。1996年9月正式建院，同年被评为“三级甲等”专科医院。
医院设有特需诊疗科、肝外一科、肝外二科、腹腔镜病区、胆道外科等15个临床科室和实验诊断科等10个医技科室，展开病床660张。设有中美合作肿瘤免疫和基因治疗中心、中日合作内窥镜治疗中心、中德合作生物信号传导研究中心以及肝脏移植中心。
医院先后获军队科技进步二等奖以上成果17项。
长征医院南京分院
二军大长征医院南京分院是一所集医疗、科研教学为一体，专科齐全，设备和先进，技术水平精湛的综合性医院。1998年被军区总部授于“三级甲等医院”，江苏科研先进单位，是解放军医学院，江苏中医学院和等院校的实习基地，医院现有专业技术人员400余名，拥有床位500余张，同时是江苏省医保定点单位，同时并于2003年全院进入“军字一号”网络管理系统。
