历史沿革
1934年，建校原名为广州培桂中学，知名教育家马君武任首任校长。
1937年，该校被迫辗转迁到广西农村。
1945年，抗战胜利，学校返穗，在东山现址重整旗鼓，继续办学。
1949年，著名语言学大师王力任董事长
1953年，改为公立，正式定名为广州市第十六中学。
1960年至1964年曾一度改为中山医学院附属中学。
1993年，该校被为批广东省一级学校。
2006年，该校通过了广东省国家级示范性普通高级中学初期督导验收。
2007年，该校被评为广东省高中教学水平评估优秀等级学校。
2010年，该校设南校区（原广州市第七十九中学）。
2014年学校迎来80周年庆典。
2015年11月1日，广州市第十六中学迎来了建校81周年校友返校日活动。
办学条件
硬件设施
截至2014年6月，该校有红楼、东楼、实验楼、电教楼、体艺楼、行政楼、学生公寓、200米环形跑道（附设130米直跑道）运动场、室内体育馆、阅览室、管弦乐室、心理咨询室、美术室、舞蹈室、有两层图书馆面积达到532平方米，室内乒乓球馆各1个，篮球场5个，排球场1个，羽毛球场4个，语音室3间，承担全国普通高考和广州市中考英语听说考场工作，寄宿制学校建有1000M主干校园网，教育教学信息资源库，现代办公管理系统，所有教室、实验室和学科功能室均配有多媒体计算机教学平台。
办学规模
截至2014年6月，该校占地面积为31681平方米，建筑面积为10470平方米。有教学班40个，在校学生2000余名。
师资力量
截至2014年6月，该校有教职工150人，特级教师1人，高级教师90人，有研究生学历的教师89人。中级职称教师79人。省市高级教师评审委员会入库评委、中级教师评审委员会入库评委共15人，市区教研会会长理事共8人、市学科教研中心组成员25人。
特级教师：杨霞
办学成果
学生成绩
考试成绩
2012年高考，该校高考本科率高达94%，高考升学率100%。
2013年高考，该校高考重点本科共187人，重点上线率34%；本A上线率达85.4%。
2014年高考，该校高考重点本科上线272人，上线率50%；本A上线489人，上线率90%，本科上线人数529人，上线率97%。
2015年高考，该校高考重点本科上线262人，上线率48.4%；本A上线506人，上线率92.71%，本科上线人数544人，上线率99.6%，实验班高考重本上线率达93%
2016年高考，高考重点本科上线率达53%，创学校历史新高！高考重点本科上线人数位居越秀区第一！高考本科上线率达97%，本科上线人数位居越秀区第一！高考上线率100%！高考重点本科上线率、本科上线率、专A、专B上线率均超额完成区“跨越指标”！
学科竞赛
截至2015年6月，该校学生参加各类竞赛获全国奖170项，省级奖90项，市级奖475项，区级奖224项，总数达到961项。
素质竞赛
截至2015年10月，该校学生在健身操比赛，大课间体育活动评比，广州市第十届合唱节等活动中获得多项奖项。
教师成绩
截至2007年12月，该校干部教师获奖或在各级各类刊物发表的论文共300多篇，正式出版的教育教学专著20余本。截至2007年12月，该校干部教师获奖或在各级各类刊物发表的论文共300多篇，正式出版的教育教学专著20余本。
学校荣誉
截至2014年6月，学校共获得以下荣誉：
文化传统
校徽
该校校徽还经过艺术变形的“16中”三字组成。“16”两字像一轮红日，“中”字像破土而出的幼芽，“十六中”三字合起来又像含苞欲放的花朵。
校训
立志、勤奋、严谨、尚美
学校社团
截至2014年6月，学校有以下社团：
