办学历史
2004年，南通大学由原南通医学院、南通工学院、南通师范学院三所公办本科院校合并组建而成。原南通医学院、南通工学院的前身分别是私立南通医学专门学校和南通纺织专门学校，由近代著名实业家、教育家张謇先生于1912年创办。
南通医学院
南通医学院的前身是私立南通医学专门学校，1912年3月由清末状元张謇及其兄张詧创办，是中国最早创办的高等医学院校之一。
1927年，南通医学专门学校改为私立南通医科大学。
1928年，南通的农、纺、医三所大学合并为私立南通大学，继而成为南通大学医科。
1930年11月，私立南通大学改为南通学院。
1937年下半年，日本帝国主义扩大侵略战争，南通学院被迫停课。
1938年8月，南通学院迁至上海，农科、纺织科复课，医科与江苏省立医政学院合并建成国立江苏医学院。
1946年，南通学院院本部迁返南通，同时恢复医科。
1952年全国高等学校院系调整，南通学院医科改建为公立医学院，定名苏北医学院。
1956年改名南通医学院。
1957年，南通医学院迁往苏州，改名苏州医学院（现苏州大学医学部），同时在南通建立苏州医学院南通分部。
1958年，南通分部又改为南通医学院。
1958年，南通医学院归属江苏省管理。
1978年9月，隶属关系改由交通部和江苏省双重领导，以交通部领导为主的体制。
1979年，开始招收研究生。
1981年，成为国务院批准的首批具有硕士学位授予权单位。
2000年2月起，南通医学院由隶属交通部划转江苏省人民政府管理，实行中央与地方共建，以地方为主的管理体制。
南通工学院
南通工学院的前身是南通纺织染传习所，创建于1912年4月。
1913年9月更名为南通私立纺织专门学校，是中国第一所纺织高等院校。
1927年改为南通纺织大学。
1928年与医科、农科合并为私立南通大学。
1930年为南通学院纺织科。
1952年全国高等院校院系调整时，南通学院纺织科迁至上海并入华东纺织工学院（后改为中国纺织大学，现东华大学）。
1977年12月，经省人民政府同意复建，成立南京工学院南通分院。
1979年1月，经国务院批准改称南通工业专科学校。
1980年7月，省政府报经教育部批准，改名为南通纺织专科学校。
1985年1月，省人民政府报经国务院批准升格为南通纺织工学院。
1995年9月，经国家教委批准，更名为南通工学院。
南通师范学院
南通师范学院是由原南通师范专科学校和南通教育学院于1999年3月经国家教育部批准合并组建的本科高等院校。
南通师范专科学校创建于1958年，1962年停办。
1976年12月，经省政府批准以“扬州师范学院南通分院”名称恢复办学。
1979年2月，经国务院批准，恢复“南通师专科学校”校名。
南通教育学院前身是南通地区教师进修学院和南通市教师进修学院。南通地区教师进修学院于1959年经省教育厅批准成立，1963年停办。
1982年3月，经省政府同意，建立南通地区教师进修学院和南通市教师进修学院。
1983年3月，南通市委决定两院合并，建立新的南通市教师进修学院。
同年7月，经省政府批准南通市教师进修学院定名为南通教育学院。
南通大学
2004年5月18日，经教育部批准，南通医学院、南通工学院、南通师范学院三所公办本科院校合并组建南通大学。
2003年，拥有联合培养博士点。
2005年3月，学校在原南通工学院张謇研究所和原南通师范学院张謇研究所的基础上组建张謇研究所。
2009年，被批准为博士学位授予立项建设单位。
2013年，成为博士学位授予单位。
同年5月，入选第一批临床医学硕士专业学位研究生培养模式改革试点高校。
2016年2月，农业部南方平原玉米科学观测实验站正式落户学校。
7月，学校与南通市人民检察院签订检校共建协议。
2017年6月，南通大学正式加入“中美人才培养计划”121项目，并与美国北阿拉巴马大学结成姐妹学校。
2019年8月，南通大学附属启东医院签约揭牌仪式在启东市人民医院举行。
9月，南通大学与连云港高新技术产业开发区管理委员会签署战略合作协议。
10月，学校获评“中美人才培养计划”121项目先进单位。
11月，学校与华为技术有限公司签订战略合作协议。
12月，南通大学附属海门医院签约揭牌仪式在海门市人民医院举行；
同月，南通大学举行张謇研究院揭牌暨首批特约研究员聘任仪式；同月，学校举行南通大学—上海航天精密机械研究所全面合作暨SPMI航天轻材奖学金签约仪式。
同年，学校取得面向港澳台地区招生资格。
2020年4月，学校被评为“江苏省实验动物工作成效突出集体”；同月，学校荣获“江苏省五一劳动奖状”。
5月，南通大学校附属泰州妇产医院签约揭牌仪式在泰州妇产医院（泰州市妇女儿童医院）举行；同月，南通大学附属如皋医院签约揭牌仪式在如皋市人民医院举行；同月，南通大学附属肿瘤医院更名揭牌仪式在南通市肿瘤医院举行。
6月，南通大学附属通州医院签约揭牌仪式在南通市通州区人民医院举行；同月，南通大学附属瑞慈医院签约揭牌仪式在南通瑞慈医院举行。7月，学校被授予“南通市慈善工作先进单位”荣誉称号。
8月，南通大学附属南通口腔医院签约揭牌仪式在南通市口腔医院举行。
9月，江苏省教育厅与南通市签约共建南通大学。
院系专业
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师资力量
学校现有教职工3367人（含杏林学院152人），其中高级职称以上1659人，博士、硕士生导师1550余人。共有两院院士、长江学者、国家万人计划领军人才、“百千万人才工程”国家级人选、国家杰出青年科学基金获得者、国家优秀青年科学基金获得者、中科院“百人计划”入选者、“973”项目首席科学家、国家重点研发计划项目首席科学家、奥运会冠军、江苏省“333”高层次人才、江苏特聘教授等各类杰出人才。
教学建设
学校设有20个学院、1个独立学院（杏林学院）、1家直属大型综合三级甲等医院（南通大学附属医院）和国际教育学院、继续教育学院。拥有基础医学、临床医学、信息与通信工程3个博士后流动站，基础医学、临床医学、信息与通信工程3个一级学科博士点，22个一级学科硕士点，10个硕士专业学位点。
临床医学、神经科学与行为学、工程学、药理学与毒理学、生物与生化等5个学科进入ESI学科全球排名前1%。拥有江苏省高校优势学科2个、江苏省重点学科8个、江苏省临床医学重点专科26个。
文化传统
学校标识
校徽
体现南通大学新校区建筑设计“水乡书院”的意象：好象绿色的玉壁，镶嵌在江海之滨。外形设计处理成击打传声的玉磬，“清亮之声，闻者倾倒”。
有别于震旦的钟声，喻示南通大学通古纳今传承文明的历史责任。其形也如升腾的风筝和具有地域特色的瓦当。自下而上，由短到长对称排列递次舒展的五根曲线，恰似五山叠翠，又如传统水纹，暗喻南通濒江临海的地理位置，也体现学校多学科的综合性。
校徽简洁明快、言简意赅，一形多义，既富于传统文化底蕴、地域特色，又具现代图式的特征和新颖别致的原创性，与兄弟院校校标并置别具一格，图案所传递的蓬勃向上的视觉张力，体现了南通大学这所新世纪新学校的新的精神风貌。
精神文化
校训
祈通中西，力求精进
分别取自于张謇先生为原南通学院医科、纺织科所提训词“祈通中西 以宏慈善”、“忠实不欺 力求精进”。“祈通中西”是南通大学的教育理念，同时也是学校事业发展的目标。
“力求精进”是南通大学的核心价值观和始终保持的精神状态。“力求”是一种态度，是在目标下的积极进取的精神状态。“精进”意指精心一志，努力上进，开拓进取，拼搏攀登，为推动社会发展作出贡献。“精”有精确、精致、精美的含义，内生有科学、完美的意蕴。“进”是一种发展的状态。
“精”、“进”两者合用表达了追求完美的价值取向。南通大学是一所年轻的综合性大学，要实现“立足南通、服务全省、面向全国、逐步走向世界”的目标，务必使我们每一个通大人始终保持追求卓越、尽善尽美的价值追求，始终保持不断进取、敢于争先的良好精神状态。
“祈通中西 力求精进”的内涵具有解释的广延性，校训的意义也是在凝聚人心、引导行为、形成传统的过程中，不断彰显和深化的。
校歌
南通大学校歌
作词 张孝若 作曲 徐立孙
南通大学，三院鼎立，钟灵毓秀根脉弘。
真才造就，实学研攻，往绩可述，来绩无穷。
愿我人继前人之志，尽我人之力，益大益充。
传校誉于后世，建大业于寰中！
