發展曆史
因為重慶力帆在2003-2010年賽季，七年之中在國内頂級聯賽墊底四次，被喻為“墊底王”影響重慶的城市形象。加上2010年賽季結束後，當時有傳力帆集團有意撤資力帆隊，而重慶市體育局直接接手重慶力帆存在太多麻煩，為推動重慶足球長遠發展，擺脫長期低迷的頹勢。所以有另一種意見，是讓重慶市體育局或重慶足協另起爐竈，成立新的足球俱樂部。正是在這樣的背景下，重慶足球俱樂部在2010年12月注冊成立。
2011年2月，俱樂部确定由裴恩才擔任俱樂部的首任主教練及在全國海選球員，最終确定31人的球員名單參加在同年的乙級聯賽，球員名單當中較著名的球員有李思源、萬程、邸佑及多名曾效力中超球隊及有職業聯賽經驗的球員。6月6日，裴恩才因聯賽成績欠佳而下課。6月21日，趙發慶成為重慶俱樂部新任主教練。重慶後來居上以南區預賽第二名晉級決賽階段。11月，球隊在半決賽客場擊敗東莞南城升入中甲聯賽，但其後在主場進行的決賽不敵哈爾濱毅騰獲得乙級聯賽亞軍。
球隊成績
2011年11月18日，重慶足球俱樂部沖甲成功。
2012賽季獲得中甲聯賽第八名。
2013賽季因相互戰績不占優，在與成都同分的情況下，以聯賽倒數第二的成績慘遭降級。
曆年賽事
2011年中乙聯賽
裴恩才成為2011年中乙聯賽下課第一人
2011年6月6日下午三點，中乙球隊重慶俱樂部宣布主帥裴恩才下課，裴恩才也成為了2011賽季中乙聯賽首位下課的主教練，助理教練員王軍也同時離任。
5月8日聯賽開始後，球隊表現欠佳，比賽成績不理想，前兩輪均以0：1不敵對手，第三輪雖在主場4：0橫掃廣州青年，但之後客場以0：2不敵福建，第五輪主場對陣湖北隊又以1:1被逼平。五輪比賽僅積4分，沖甲形勢變得嚴峻，糟糕的戰績成為了裴恩才提前下課的原因。
有消息稱，當初俱樂部和裴恩才簽訂合同時，一旦前5輪比賽球隊拿不到5個積分，裴恩才将被自動解雇。不過這一說法沒有得到重慶俱樂部的證實。
趙發慶接任重慶足球俱樂部主帥
2011年6月21日下午，趙發慶出現在訓練場邊接過重慶足球俱樂部教鞭，正式成為重慶隊主教練。
2011年二次轉會重足引進三名内援
針對聯賽上半程暴露出的問題重慶足球俱樂部在2011年二次轉會工作中引進了三名效力中超的實力球員，他們是鄭偉、馬曉磊和郭明月，其中鄭偉效力上海申花此前效力過陝西隊在中超表現不俗有過多次助攻是一名組織中場，馬曉磊原深圳紅鑽球員後轉會安徽九方可以踢前鋒和前衛在中超和中甲都有過進球，郭明月效力于江蘇舜天此前效力湖北隊可以踢後衛和後腰。
重慶足球俱樂部2011中乙聯賽戰況：
第一輪5月8日，重慶足球俱樂部0:1東莞南城同舟化工
第二輪5月14日，四川都江堰欣寶1:0重慶足球俱樂部
第三輪5月21日，重慶足球俱樂部4:0廣州青年（重慶足球俱樂部取得正式比賽首場勝利，
歐陽雪打進重慶足球俱樂部正式比賽首粒入球）
第四輪5月28日，福建駿豪2:0重慶足球俱樂部
第五輪6月5日，重慶足球俱樂部1:1湖北三大康天
第六輪6月11日，上海中邦2:2重慶足球俱樂部
第七輪6月18日，輪空
第八輪6月25日，重慶足球俱樂部2:2廣東青年
第九輪7月2日，湖北青年0:3重慶足球俱樂部（重慶足球俱樂部正式比賽客場首次取得勝利）
第十輪7月9日，重慶足球俱樂部1:0浙江溫州葆隆
第十一輪7月31日，四川俱樂部川大0:4重慶足球俱樂部
第十二輪8月6日，東莞南城同舟化工0:1重慶足球俱樂部
第十三輪8月13日，重慶足球俱樂部2:0四川都江堰欣寶
第十四輪8月17日，廣州青年1:1重慶足球俱樂部
第十五輪8月21日，重慶足球俱樂部1:0福建駿豪
第十六輪8月27日，湖北三大康天1:1重慶足球俱樂部
第十七輪9月1日，重慶足球俱樂部2:1上海中邦
第十八輪9月5日，輪空
第十九輪9月10日，廣東青年1:2重慶足球俱樂部
第二十輪9月15日，重慶足球俱樂部3:2湖北青年
第二十一輪9月20日，浙江溫州葆隆2:1重慶足球俱樂部
第二十二輪9月24日，重慶足球俱樂部3:0四川俱樂部川大
中乙複賽階段：
1/4決賽首回合10月6日：山東男足2：1重慶足球俱樂部
1/4決賽次回合10月10日：重慶足球俱樂部3：1山東男足，經過兩回合較量重慶足球俱樂部總比分4：3淘汰山東男足，順利進入中乙4強，下個對手是東莞南城同舟化工，兩回合勝者将進入明年中甲聯賽。
半決賽首回合11月14日：重慶足球俱樂部0：0東莞同舟南城
半決賽次回合11月18日：東莞同舟南城0：3重慶足球俱樂部，重慶足球俱樂部進入明年中甲。
中乙總決賽11月24日：重慶足球俱樂部1：1哈爾濱毅騰（點球4：5），重慶足球俱樂部獲得2011年中乙亞軍并獲得2012中甲資格。
2012年中甲聯賽
2012賽季名單
主教練：趙發慶
重慶足球俱樂部2012引援狀況：
内援：黎斐（原深圳紅鑽，深圳隊隊長）、沈龍元（原杭州綠城，國奧球員參加過2008奧運會）、徐擎（原貴州人和）、滕尚坤（原杭州綠城，國青隊打過主力門将）、王聖（原撫順罕王，白金一代國奧隊主力，長期效力大連實德隊）、崔棋（遼甯宏運二隊）
外援：基倫（新西蘭人，現役新西蘭國家隊主力前鋒，2010年世界杯新西蘭隊主力球員）、沃爾特·馬丁内斯（洪都拉斯人，2010世界杯洪都拉斯主力球員）、佩雷斯（哥倫比亞人）。
重慶足球俱樂部2012中甲聯賽戰況：
第一輪3月17日，重慶FC0：2北京理工大學。
第二輪3月24日，廣東日之泉1：2重慶FC（王聖打進重慶足球俱樂部中甲聯賽上第一球，馬曉磊也攻進一球，同時也是重慶足球俱樂部中甲聯賽上的首次勝利）。
第三輪3月31日，重慶FC在奧體中心以4：1大勝重慶力帆，取得重慶足球曆史上首次同城德比的勝利。馬曉磊、歐陽雪、基倫、小馬丁内斯各打進一球。
第四輪4月7日，深圳紅鑽4：2重慶FC，基倫和郭明月進球。重慶FC也遭遇了球隊中甲曆史上的首次客場失利。
第五輪4月14日，重慶FC1：0沈陽沈北，基倫點球建功。
第六輪4月23日，重慶FC0：0延邊長白虎，這也是重慶FC征戰中甲聯賽中的第一場平局。
第七輪4月29日，重慶FC0：2湖南浏陽河。
第八輪5月5日，北京八喜1：2重慶FC，王聖進球，歐陽雪最後時刻絕殺。
