故事背景
一九九六年，一場由不知名财團贊助的世界級盛會《THE KING OF FIGHTERS》再次舉行，傳說中的三神器在此次格鬥大會中全部出現，草薙京、八神庵以及作為此次大會的主辦者神樂千鶴。
擊敗了其他的參賽選手後，在此次大會的主會場，神樂千鶴考驗戰勝隊的真正實力後，她會請求戰勝隊去封印即将釋放的大蛇一族，一陣風暴破壞了整個會場，擁有控制暴風力量的高尼茨出現了，最終高尼茨被擊敗，不過最終飄散在風中的大蛇一族的血液似乎影響了莉安娜以及八神庵……
拳皇96大會不再是如同前兩年一般的迷霧重重，而是由無數的大企業贊助的世界性格鬥大會。
預選賽在世界各地召開，強手如雲的9支隊伍當中，免不了出現大家熟悉的面孔，公開的初賽也讓大家興奮不已。
然而這中間也有令人驚訝的出現，由比克（MR.BIG）、克勞薩（KRUSER）、吉斯（GEESE）這三位曾幾何時想要稱霸世界的人物，也組成一支強勁的隊伍參加。
他們的目的，是鏟除波格兄弟和極限流空手道的繼承者嗎？還有與迷一般的兩位女性組隊再度參賽的八神庵，和京有着隔世宿怨的他到底會怎麼行動？這使得公開的拳皇96也籠上了一層陰影。
拳皇96到了尾聲，主辦者神樂千鶴現身。原來她和京、庵一樣，同是傳說中的三神器之一的守護者。天國神族四天王之一的暴風複活了，要解開大蛇OROCHI的封印，将世界推入毀滅。
為了阻止他的野心，神樂舉辦了拳皇96尋求天下強者聯手應敵，主要目标就是京和庵。充滿正義感的京自然會答應她的請求，但是庵呢？他怎麼可能和京聯手？更何況，從暴風口中得知，其實他也不是人類，而是神族的王子！然而經曆種種曲折，兩位宿敵終于暫時站在了一起，大蛇薙和八稚女交相輝映，與暴風展開了血戰，三股力量交相輝映，連天地都發出了顫抖。
終于暴風敗了，化做清風飛向天國。京和庵再次回複了對立。八神抑制不了體内洶湧澎湃的力量，陷入了瘋狂狀态。對身邊的人展開了殘殺……
出招表
1基本操作
A輕拳
B輕腳
C重拳
D重腳
A+B後緊急回避
→A+B前緊急回避
A+B+C蓄氣
B+C挑釁
C+D超重擊
→→前沖
←←急退
指定人物可以側身回避
2出招表
主人公隊
草薙京KYOKUSANAGI
百式·鬼燃燒:→↓↘+A或C
百一式·胧車:←↓↙+B或D
二百一撿式·琴月陽:→↘↓↙←+B或D
七十五式·改:↓↘→+B或D
百十四式·荒咬:↓↘→+A
百二十式·九傷荒咬中:↓↘→+A或C
百二十式·八锖:九傷中A或C
荒咬中:→↘↓↙←+A或C
百二十式·七濑:九傷或八锖中B或D
外式·砌穿:八锖中A或C
百十五式·毒咬:↓↘→+C
四百一式·罪詠毒咬中:→↘↓↙←+A或C
四百二式·罰詠罪詠中:→+A或C
九百十式·鶴摘:↓↙←+A或C
★裡百八式·大蛇薙:↓↙←↙↓↘→+A或C
二階堂紅丸BENIMARUNIKAIDO
真空片手駒:→↘↓↙←+B或D
居合蹴:↓↘→+B或D
反動三段蹴:居合蹴中↓↑+B或D
反動三段蹴:←↓↙+B或D
超級閃電踢:→↓↘+B或D
雷韌拳:↓↘→+A或C
空中雷韌拳:空中↓↘→+A或C
紅丸投:近身←↙↓↘→+C
★雷光拳:↓↘→↓↘→+A或C
大門五郎GORODAIMON
地雷震:→↓↘+A或C
超受身:↓↙←+B或D
天地返:近身→↘↓↙←→+C
出雲投:←↙↓↘→+A
切株返:←↙↓↘→+C
超大外割:←↙↓↘→+B
★地獄極樂落:近身(→↘↓↙←)×2+C
新龍虎拳隊
坂崎良RYOSAKAZAKI
虎咆:→↓↘+A或C
虎煌拳:↓↘→+A或C
飛燕疾風腳:→↘↓↙←+B或D
極限流連舞拳:近身←↙↓↘→+A或C
猛虎雷神剛:↓↙←+A或C
★霸王翔吼拳:→←↙↓↘→+A或C
★龍虎亂舞:↓↘→↘↓↙←+A或C
羅伯特ROBERTGARCIA
龍擊拳:↓↘→+A或C
龍牙:→↓↘+A或C
飛燕龍神腳:空中↓↙←+B或D
極限流連舞腳:近身←↙↓↘→+D
飛燕旋風腳:→↙↓↘←+B或D
★霸王翔吼拳:→←↙↓↘→+A或C
★龍虎亂舞:↓↘→↙↓↘←+A或C
坂崎由莉YURISAKAZAKI
虎煌拳:↓↘→+A或C
雷煌拳:↓↘→+B或D
百烈掌打(逮):→↘↓↙←+C
空牙:→↓↘+A或C
裡空牙:強空牙着地→↓↘+A或C
百烈掌打:近身→↘↓↙←+A
飛燕疾風拳:↓↙←+A或C
飛燕旋風腳:↓↙←+B或D
★霸王翔吼拳:→←↙↓↘→+A或C
★飛燕鳳凰腳:↓↘→↘↓↙←+B或D
新女性格鬥家隊
不知火舞MAISHIRANUI
花蝶扇:↓↘→+A或C
龍炎舞:↓↙←+A或C
必殺忍蜂:←↙↓↘→+B或D
飛翔龍炎陣:→↓↘+B或D
飛鼠之舞:→↘↓↙←+A或C(可空中)
★超必殺忍蜂:↓↙←↙↓↘→+B或D
藤堂香澄KASUMITODOH
降破:↓↘→+A或C
空中降破:空中↓↘→+A或C
白山桃:↓↙←+A或C
滅身無投:←↙↓↘→+B
殺掌陰蹴:←↙↓↘→+D
龍卷槍打:近身→↘↓↙←+C
★超降破:↓↘→↓↘→A或C
京KING
毒蛇擊:↓↘→+B或D
落地擊:→↓↘+B或D
雙毒蛇擊:↓↘→↓↘→+B或D
龍卷踢:→↘↓↙←+B或D
驚異玫瑰:→↓↘+B或D
妄想踢:←↙↓↘→+B或D
★幻象之舞:↓↘→↘↓↙←+B或D
餓狼傳說隊
特瑞伯格TERRYBOGARD
能量波:↓↘→+A或C
火焰沖拳:↓↙←+A或C
灌藍強擊:→↓↘+B或D
倒躍踢:→↓↘+A或C
碎石踢:↓↙←+B或D
★能量噴泉:↓↙←↙→+A或C
安迪伯格ANDYBOGARD
飛翔拳:↓↙←+A或C
升龍彈:→↓↘+A或C
擊壁背水掌:近身←↙↓↘→+A或C
斬影拳:↙→+A或C
空破彈:←↙↓↘→+B或D
我彈幸:斬影拳中↓↘→+A或C
幻影不知火:空中↓↘→+B或D
幻影不知火·下颚:幻影不知火着地中A或C
幻影不知火·上颚:幻影不知火着地中B或D
★超裂破彈:↓↙←↙↓↘→+B或D
東丈JOEHIGASHI
旋風拳:←↙↓↘→+A或C
爆烈拳:連按A或C
虎破腳:→↓↘+B或D
電光踢:←↙↓↘→+B或D
黃金之踵落:↓↙←+B或D
爆裂拳終結:爆烈拳中↓↘→+A或C
★死亡龍卷風:↓↘→↓↘→+A或C
超能力戰士隊
麻宮雅典娜ATHENAASAMIYA
精神力球:↓↙←+A或C
鳳凰箭:空中↓↙←+A或C
劃空光劍:→↓↘+A或C(可空中)
精神力反射波:→↘↓↙←+B或D
心靈傳送術:↓↘→+B或D
★閃光水晶波:←→↘↓↙←+A或C
★空中閃光水晶波:空中←→↘↓↙←+A或C
★水晶超射閃光:水晶波後↓↙←+A或C
椎拳崇SIEKENSOU
超球彈:↓↙←+A或C
龍颚碎:←↓↙+B或D
龍爪擊空中:↓↙←+A或C
龍連牙·地龍:←↙↓↘→+A
龍連牙·天龍:←↙↓↘→+C
★神龍天舞腳:↓↘→↘↓↙←+D
★神龍凄煌裂腳:↓↘→↘↓↙←+B
鎮元齋CHINGENTSAI
飄箪擊:↓↙←+A或C
柳磷蓬萊:→↓↘+A或C
回轉空突拳:←↙↓↘→+B或D
望月醉中:←↙↓↘→+B或D
醉管卷翁中→+B或D
醉管卷翁:↓↘→+A或C
蝶襲鲑魚:醉管卷翁中→+A或C
望月醉:↓↙←+B或D
龍蛇反蹦:望月醉中↑+B
鯉魚反蹦:望月醉中↑+D
★轟欄炎炮:↓↘→↓↘→+A或C
新怒之隊
拉爾夫RALF
機炮拳:連按A或C
格林機關炮:←蓄→+A或C
超級阿根廷攻擊:近身←↙↓↘→+D
急降下爆彈:↓蓄↑+A或C
拉爾夫踢:←蓄→+B或D
超級機炮拳:↓↘→↘↓↙←+A或C
★乘馬機炮拳:↓↘→↘↓↙←+B或D
克拉克CLARK
機炮拳:連按A或C
超級阿根廷攻擊:近身←↙↓↘→+D
旋轉搖藍:←↙↓↘→+A或C
科學怪人抓:←↙↓↘→+B
凝固汽油彈:→↓↘+A或C
烈火閃光肘:指令投中↓↘→+A或C
★終結阿根廷攻擊:(→↘↓↙←)×2+C
莉歐娜LEONA
月光鋸:↓蓄↑+A或C
威武軍刀:←蓄→+B或D
口徑炮:↓蓄↑+B或D
渦旋發器:←蓄→+A或C
★V字金鋸空中:↓↘→↘↓↙←+A或C
韓國隊
金家藩KIMKAPHWAN
飛燕斬:↓↑蓄+B或D
半月斬:↓↙←+B或D
飛翔腳:空中↓↘→+B或D
流星落:←蓄→+B或D
空砂塵:↓蓄↑+A或C
★鳳凰腳:↓↙←↙→+B或D
陳可漢CHANGKOEHAN
鐵球粉碎擊:←蓄→+A或C
鐵球大回轉:連按A或C
鐵球飛燕斬:↓蓄↑+B或D
大破壞投:近身→↘↓↙←+C
★鐵球大暴走:↓↘→↘↓↙←+A或C
蔡寶健CHOIBOUNGE
龍卷疾風斬:↓蓄↑+A或C
飛翔空裂斬:↓蓄↑+B或D
飛翔腳:空中↓↘→+B或D
旋風飛猿刺突:←蓄→+B或D
方向轉換:飛翔空裂斬或旋風飛猿突中方向+攻擊鍵
疾走飛翔斬:←蓄→+A或C
★真!超絕龍卷真空斬:(→↘↓↙←)×2+A或C
八神隊
八神庵IORIYAGAMI
百式·鬼燃燒:→↓↘+A或C
二百十二式·琴月陰:→↘↓↙←+B或D
百二十七式·葵花:↓↙←+A或C(可3回)
百八式·暗鈎手:↓↘→+A或C
屑風近身:←↙↓↘→+C
★禁千二百十一式·八稚女:↓↙←↙↓↘→+A或C
麥卓MATURE
死亡墜落:↓↙←+A或C(可3回)
鋼鐵屠殺:↓↙←+B或D
絕望之手:↓↘→+A或C
決擇摔擊:←↙↓↘→+A或C
★天國滑行:↓↙←↙↓↘→+B或D
薇思VICE
殘暴踢:↓↙←+B或D
空中殘暴踢:空中↓↙←+B或D
印度賀禮:近身→↘↓↙←→+C
決擇摔擊:←↙↓↘→+A或C
★連續反射打:近身(→↘↓↙←)×2+C
BOSS隊
比克先生MR·BIG
大地爆彈:↓↘→+A或C
十字沖擊:→↘↓↙←+A或C
旋轉長矛:→↘↓↙←+B或D
加州羅曼史:→↓↘+A或C
瘋狂之鼓:連按A或C
★飛龍升天棍:↓↘→↓↘→+A或C
吉斯霍華德GEESEHOWARD
烈風拳:↓↘→+A
烈風雙拳:↓↘→+C
疾風拳空中:↓↙←+A或C
上段當身投:←↙↓↘→+B
中段當身投:←↙↓↘→+D
邪影拳:→↘↓↙←+A或C
飛翔日輪斬:→↓↘+A或C
★鬥氣風暴:↙→↘↓↙←↘+A或C
沃爾夫岡克勞薩WOLFGANGKRAUSER
上段破碎球:↓↙←+A或C
中段破碎球:↓↙←+B或D
戰斧踢:↓↘→+B或D
帝王踢:→↓↘+B或D
帝王絕滅踢:←↙↓↘→+B或D
帝王壓制技:近身→↘↓↙←→+C
★凱撒波動拳:→←↙↓↘→+A或C
隐藏人物兼BOSS
神樂千鶴CHIZURUKAGURA
百活·天神之理:→↓↘+A或C
二百式二活·神速之祝詞:→↘↓↙←+任一鍵
二百式二活·神速之祝詞·天瑞:神速之祝詞動作中↓↙←+任一鍵
百八活·玉響之瑟音:←↙↓↘→+A或C
★裡面八十五活·零技之礎:↓↙←↙↓↘→+A或C
★裡而一活·三籁之布陣:→↘↓↙←→↘↓↙←+B或D
高尼茲GOENITZ(普通超殺可随意使用)
腕電·真空波:←↙↓↘→+任一鍵
腕電·磨滅:↓↙←+A或C
冰河:↓↙←+B或D
★黑暗哭泣:近身→↘↓↙←→↘↓↙←+A
★真八稚女·蛟:↓↙←↙↓↘→+A或C
★★(能量滿且體力槽閃紅時)真八稚女·靶:↓↙←↙↓↘→+A或C
遊戲秘籍
選出2位boss：
NEOGEOCD版專用秘技
在角色選擇畫面，按住START不放後，輸入↑+B·→+C·←+A·↓+D，成功後就可以選用兩位隐藏的最終BOSS角色。
SS版專用秘技
在角色選擇畫面，按住START不放後，輸入↑+Y·→+A·←+X·↓+B，成功後就可以選用兩位隐藏的最終BOSS角色。
PS版專用秘技
在角色選擇畫面，按住START不放後，輸入↑+○·→+口·←+×·↓+△，成功後就可以選用兩位隐藏的最終BOSS角色。
随意觀看結局：
SS版/PS版專用秘技
1.難度不限，以正規隊伍（比如特瑞+安迪+東丈）在不續關的情況下來完成TEAMPLAY模式。
2.難度不限，以正規隊伍中的任一人（比如選特瑞，那通關後出現的就是餓狼隊的結局）在不續關的情況下來完成SINGLEPLAY模式。
達成以上兩項的任何一項，OPTION中便會追加DEMOSELECT模式，玩家可在該模式内随時查看已用上述方法爆機的相關隊伍的過場及結局動畫。
兩個特别結局：
NEOGEOCD版/SS版/PS版專用秘技
選用“草薙京”、“八神庵”、“神樂千鶴”三人組成一隊來進行遊戲，通關之後便會有“三神器”隊的特殊結局。
選用“高尼茲”，再加上“神樂千鶴”以外的任何兩位人物來通關，通關之後也會有特殊結局。注：本特殊結局其實MVS街機版和NEOGEO家用卡帶版也是有的，不過問題是正常情況下這兩個版本是無法使用兩名BOSS的。
操作指南
拳皇96一開始進入遊戲，窗口可以用鼠标拖拽，大小形狀随你心意。
遊戲的按鍵在遊戲-重新定義鍵位設定(如右圖).玩家可以根據自己的喜好進行設置.
投币=9P1開始=1P2開始=2暫停=P全屏切換=ALT+回車設置菜單=TAB
P1方向=WASD按鍵=UIJK
P2方向=↑↓←→按鍵=小鍵盤1245
注:開始遊戲時如果出現英文提示,按小鍵盤←→鍵跳過
遊戲點評
拳皇96為了使系統更具攻擊性，追加了緊急回避動作以及小、中跳躍，從此作開始，側身閃避變成了緊急回避。後來的97、98證明，這種變革是極其明智的。還有發超必殺技時身體會乍現藍光，也是讓人眼前一亮的設定。随着系統的大幅度變更，遊戲節奏上升帶來的快感無與倫比。但是POWER的積蓄方式還是老套，人物攻擊力還是過強。更要命的是，系統的不成熟改變會帶來大量的BUG，如八神的輕松鬼步，曾讓許多人痛責不已。
總的說來，拳皇96不是一部很成功的作品，缺點和優點同樣明顯。但它是97的雛形，為不朽經典的推出打下了最堅實的基礎。
另外，在此作中，京和八神的宿命也在遊戲中有所提及，大蛇一族的存在也露出水面。在前作的基礎上，登場人物變化比較大，首先是吉斯、可克勞撒、Mr.BIG組成的BOSS隊加入，藤堂香澄取代了坂崎由莉加入女子格鬥隊，坂崎由莉則代替了老爸同坂崎良，羅伯特一組。莉安娜也替父哈迪蘭從軍。而八神同組的隊員比利和如月影二也變成了麥卓和薇恩。而在系統設定上96摒棄了前作成熟的系統設定，側身回避這一設定修改為緊急回避，側身回避隻供指定人物使用，且無敵時間變短。追加了更加華麗的MAX超必殺，當能量槽蓄滿時，可以消耗能量槽能量進行防守時緊急回避，和防守時反擊。簡化了必殺技的輸入指令，弱化了必殺技的傷害值，強化了連續技的使用，無限連續技也同時被大量的應用到實戰中，如八神庵的無限屑風。并且存在角色實力的不均衡、部分招式過強的問題。這些問題的存在也導緻了KOF96并未流行多長時間。
