事件回放
（注：本詞條中的“口袋妖怪”指的是根據《口袋妖怪》系列遊戲所改編的同名動畫，又被譯作“神奇寶貝”）
在隔年因觀衆熱烈反應所以口袋妖怪重出江湖，但這集“電腦戰士3D龍”已被下令禁播，成為被封印的傳說。到底内容有什麼魔力呢？為什麼又會帶來如此巨大的騷動呢？（注：這一集在中國大陸、香港和台灣都沒有播出過，所以原本是石英聯盟第38集則往後順延。）
事件原因
在以前日本制作動畫（不隻是《口袋妖怪》，其他許多動畫都采用過）為了表達震撼感，會采用背景閃爍不同顔色光的技術。在每秒24個畫面的速度下，每1～2個單位時間反複不同畫面，例如爆炸時畫面用白→黑→白→黑的快速閃光。除了達到視覺暫留的震撼效果，還能節省動畫制作的時間與成本，因此過去20年以來這一技術一直被普遍使用。
在“電腦戰士3D龍”當中，為了配合這集主要的“電腦世界”場景，爆炸的閃光都以紅→藍→紅→藍代替。另外為了達到震撼效果，這集使用了閃爍技術的頻率也比以往的高。經過制作單位檢驗後初步認為沒異狀。
不過制作單位沒考慮到，神奇寶貝在當時是轟動全日本的動畫片，觀衆中有許多眼睛比大人更敏感的青少年。加上兒童大多喜歡不眨眼地盯着電視看，而紅光跟藍光（最為刺激人眼）快速切換的速率又高達1/12秒一次，于是在這些孩子觀看動畫的同時，視神經受到強烈刺激，影響到腦部的控制，輕則不舒服，重則會昏厥或痙攣,這些現象在醫學上被稱為急性光過敏症在以往并不被人重視的光過敏症，因為這個事件而在醫學界開始大力研究，并也促成新的動畫制作規則的制定。
後續發展
在第38集出問題後，東京電視台以及日本各地電視台決議，在制訂新的動畫制作規則前先停播《口袋妖怪》以避免恐慌。并且在同一時間内也為《忍者亂太郎》等多部采用閃爍技術的動畫進行大幅度的減光處理，防止另一波的光過敏事件，之後又制定了更加安全嚴苛的制作規則（禁止使用強光閃爍技術與高色差背景）。
但《口袋妖怪》并沒有受到3D龍事件帶來的負面影響，相反地，"神奇寶貝熱"被燒得更旺。再加上在包括當時送醫的觀衆也強烈希望再度看到《口袋妖怪》動畫的情況下，東京電視台在1995年4月16日換到複播了。原定的39～42集變成了番外篇，分别放在了51、52、64和65集，正因為這樣，有些人就認為在65集出現了小火龍，這是個錯誤。而新的39集則改成原先的特别篇，動人心弦的“皮卡丘的森林”，這一集的收視率居高不下。
至今為了避嫌，3D龍以及其進化型3D龍2、3D龍z都沒辦法在神奇寶貝的動畫裡登場了。但也正是因為3D龍事件的發生，使神奇寶貝不僅扮演了動畫界研究光過敏症的先驅，還預防了其他動畫重蹈複轍，可以說，神奇寶貝和3D龍事件改變了全世界的動畫制作界。第三世代加入的拉魯拉斯精靈，和3D龍一樣是變性特性，所以動畫版基本上已被拉魯拉斯和進化體取代這一特性。
所以，我們收看的《神奇寶貝》不僅熱門，而且還是制作最嚴謹、最安全的動畫之一。
完整劇情
以挑戰石英聯盟為目标持續在關都地區旅行的小智、小霞和小剛一行人來到馬察市的神奇寶貝中心讓皮卡丘休息，但卻發現中心陷入大混亂。問喬伊小姐才知道傳送系統出了問題，傳進去的神奇寶貝都出不來。這時在一旁的傳送系統的開發者秋葉原博士似乎發現了什麼，急忙飛奔出門。好奇的小智等人随後跟進秋葉原博士的立體顯像研究所。
秋葉原博士解釋，原來是火箭隊偷走了他的3D龍零号機（可穿梭現實與電腦系統中），駭入神奇寶貝中心的傳送系統偷走神奇寶貝。這時隻要灌入掃毒程式把駭入的漏洞補好就可恢複正常，但火箭隊會被當成病毒而被消滅……
既然是可愛又迷人的反派角色，小智一行人還是硬着頭皮搭上備用的3D龍初号機前去救火箭隊出來。
在電腦系統的世界裡，一下子就發現火箭隊用路障阻擋寶貝球傳送的路線，好竊取神奇寶貝。火箭隊發現小智們就叫阿柏怪和雙彈瓦斯對抗，但卻敗在3D龍初号機的「換裝」絕招之下。火箭隊隻好派出3D龍零号機作戰。兩隻3D龍幾乎不分勝負，最後還是由3D龍初号機略勝一籌獲勝，火箭隊也當場被打飛，小智等人趕緊将路障移開以達成疏通任務。這時秋葉原忽然發現不知情的喬伊已經叫程式設計師灌入掃毒程式了！這代表連小智等人都會被當成消滅的目标……
小智他們趕緊叫已着地的火箭隊搭上3D龍零号機逃命。不久掃毒程式發射強力的滅毒火箭和光線炮，擊中3D龍零号機與火箭隊！火箭隊被擊落後掉進了程式漏洞裡。被卡在洞裡出不來的火箭隊，眼看就要被消滅了，在千鈞一發之際，小智等人趕到而把火箭隊救上3D龍初号機。但因為過重而3D龍跑不快，掃毒程式在後面朝着小智等人發射強力飛彈！※皮卡丘趕緊用電擊對着飛彈迎擊，讓飛彈爆炸并發出強烈的閃光。※
大家以為沒了飛彈而正松一口氣，但這時卻還有兩發飛彈朝着小智等人攻過來！在這瞬間小智等人及時從傳送點抵達秋葉原博士的研究所，而尾随的飛彈閃避不及，把研究所炸成廢墟。小智等人雖然被炸的烏漆抹黑，但總算是得救了。火箭隊感謝救命之恩後就一溜煙的跑了，留下秋葉原博士傷心的看着已粉碎的心血。之後再度到神奇寶貝中心的小智就把皮卡丘托給喬伊照顧，一行人把電腦世界的冒險深藏在心。
相關其他
目前在互聯網上還是能夠找到這一集的，雖然已經對有問題的片段進行了畫面處理，但是建議大家如果沒有做好防護措施，還是不要觀看的好。
