光球
太陽光球層在太陽對流區之上,是太陽大氣的最底層,厚約500km.光球層物質的平均
有效溫度為5780k,可是太陽的溫度随着高度由内向外逐漸降低,在光球與色球交界處,溫度降至4000k～4600k.光球發出的可見光最強.地球獲得的太陽光和熱的能量基本上是由光球發出.
臨邊昏暗
光球的中心區域亮于邊緣,這叫做臨邊昏暗現象.
太陽黑子
在光球上看到的暗斑叫太陽黑子.黑子的溫度比周圍光球的溫度低,大約隻有4500k.黑子是強磁場區,磁場強度約0.35～0.45T.
光斑與米粒組織
太陽光球上除了黑子以外還有溫度比光球溫度高100k左右的光亮區域,叫光斑.光斑具有不同形式的纖維狀結構.
光球上有一些像米粒似的氣團叫米粒組織,尺度大的叫超米粒組織,超粒組織的尺度約為30000km左右.
色球
光球上面的大氣層為色球層.色球層比光球層厚,約為1500km,它的内半徑約696500km.色球内各種物理參數,包括密度,電離度和各種物理過程,在色球層不同高度處于存在着巨大變化.
日冕
日冕是太陽大氣的最外層，可以延伸到幾個太陽直徑，甚至更遠。它的亮度僅為光球的百萬分之一，隻有在日全食時或用特制的日冕儀才能看見。
最新發現
科學家最近收集到了迄今為止最有力的證據，以解釋為什麼太陽的外大氣層比其表面要熱得多。新觀測到的小規模極熱溫度隻符合當前的一種理論：一種叫納耀斑的東西提供了這種神秘的極熱。納耀斑是持續出現的熱量的密集噴發，但每個噴發無法單獨被探測到。
更令人驚奇的是，新觀測到的證據僅來自美國航天局（NASA）一種最廉價的探空火箭所收集的6分鐘數據。這個名為EUNIS的探空火箭是在2013年4月23日發射的，它每隔1.3秒就會收集一組快照數據，以追蹤複雜的太陽大氣層中各種溫度的物質的特性。
據報道，在其飛行過程中，EUNIS掃描了太陽的一個預定區域，這個區域具有複雜的磁性，也就是所謂的活躍區，它也是較大規模的耀斑和日冕物質抛射的源頭。當該區域的光線進入EUNIS的攝譜儀時，儀器就把光根據不同的波長分類。光線量較大的每種波長都由一種稱為發射譜線的垂直線代表。而每條發射譜線依次也就代表太陽上不同溫度的物質。進一步的分析可以确定這種物質的密度和活動情況。
在分析了6分鐘的數據後，EUNIS研究小組找到了對應1000萬開氏度（這一溫度是納耀斑标志）的物質的一種波長。找到這種微弱的發射靠的是EUNIS設備的分辨率。攝譜儀能夠清晰無誤地辨别出代表這種極熱物質的數據。
據報道，美國航天局戈達德航天中心的太空科學家傑夫·布羅修斯說：“能夠把這種發射譜線準确地挑出來，讓我們這些光譜學工作者興奮得徹夜難眠。在活躍區的這麼一大片區域中能觀察到這種微弱的光線，的确可以說是納耀斑存在的最有力證據。”
關于納耀斑的噴射機制有着多種理論。另外有關日冕的熱量來源還有其他解釋。科學家還會繼續研究這些理論，并且随着工具和設備的改進而收集更多的證據。不過，還沒有其他理論預測過日冕中存在這種溫度的物質，因此這是支持納耀斑理論的強有力證據。
戈達德航天中心EUNIS小組的主要研究員阿德裡安·道說：“這是納耀斑存在的确鑿證據，而且這還說明，這類小型且廉價的探空火箭能帶來真正有用的科學。”
奧斯陸大學和沃裡克大學的一組研究人員首次在太陽日冕中直接觀測到扭轉阿爾夫芬波。這一發現揭示了電磁波的起源及其在太陽日冕加熱中的作用。
