曆史沿革
1907年（清光緒三十三年），時任兩江總督端方上奏清政府，修建南京市内鐵路，同年10月破土動工，該鐵路即為京市鐵路。京市鐵路是南京地鐵的前身，當時中國各大城市中唯一的小鐵路，不僅是南京城區現代化公共交通事業的發端，同時也是中國最早的城市軌道交通。
1909年（清宣統元年）1月，全線通車，共設6個車站。
1910年（清宣統二年），增設了勸業會站（後改名丁家橋站）。
1936年（民國二十五年），京市鐵路向南延伸3.8千米，增設了武定門、中華門兩站，全線為9站。
1949年，南京解放後，京市鐵路改稱“甯市線”，有關部門對鐵路進行了維修整治。
1958年11月28日，京市鐵路正式停運拆除。
1984年，南京市玄武區20位人大代表提交了“南京市興建地鐵的設想”的議案，南京地鐵項目規劃工作啟動。
1986年3月，南京市政府成立南京市交通規劃領導小組，下設地鐵專業組，正式啟動了南京地鐵前期研究工作；《南京市地鐵線路規劃初步方案》：3條地鐵、3條支線。
1988年，時任南京市副市長的戴永甯在帶領研究人員仔細考察了香港地鐵後，起草了南京市地鐵建設的第一份《項目建議書》。南京市綜合交通規劃領導小組所屬地鐵專業組組織完成了南京地鐵線網規劃初步方案，包括1條南北線、1條東西線、1條環線、3條支線，共計174.65千米，其中南北線與現在建成通車的地鐵一号線完全一緻。
1989年，南京市政府組建地鐵籌建處，在市建委的領導下開展地鐵籌建工作。
1990年2月12日，南京市地下鐵道工程籌建處成立。
1992年，三山街實驗站結合中山南路南下工程開始建設。
1993年，《南京城市總體規劃》中規劃的南京地鐵為4條地鐵線、1條地鐵支線、3條輕軌線和1條市郊鐵路線，總計238千米。
1994年，國家計委同意南京地鐵“預立項”。
1995年，國務院批複了《南京城市總體規劃》，第一次确立了軌道交通和地鐵一号線的法定地位，為地鐵一号線立項建設提供了法定依據。
1999年4月15日，國家批準南京地鐵正式立項，南京成為繼北京、上海、廣州、深圳之後第5個獲批地鐵的城市；5月28日，南京市地下鐵道工程建設指揮部、南京市地下鐵道總公司成立，《南京城市快速軌道交通線網規劃》規劃了6條地鐵線、2條地鐵支線、3條輕軌線，總計約300千米；10月，國家計委批準南京地鐵1号線工程可行性研究報告，并批準開工。
2000年11月，完成了《南京地鐵二号線一期工程預可行性研究報告》；12月12日，南京地鐵1号線一期工程在小行車輛基地舉行開工典禮。
2001年，南京市委、市政府責成市規劃局組織新一輪《南京城市軌道交通線網規劃》編制，并要求高起點、高标準完成規劃成果。南京市規劃局組織了選擇主編單位的國際招标。有8家著名的國際咨詢公司參加了本次投标，經過專家評議打分，選擇日本中央複建工程咨詢公司為本次規劃的主編單位。為确保規劃質量，規劃部門建立了嚴密的組織機制和工作計劃，規劃曆時10個月完成，引入了國際上先進的城市軌道交通線網規劃理念和技術，經過多輪分析測試和咨詢論證，确定了遠期南京城市軌道交通線網推薦方案。
2002年，日本中央複建工程咨詢公司（CFK）主編的新一輪《南京城市軌道交通線網規劃》中規劃7條地鐵線、3條輕軌線，共計365千米，中心區設4條地鐵線；主城與三大新市區（東山、仙林、江北）之間各有2條以上軌道交通線連通，其中1條直達新街口中心區；主城與外圍新城（闆橋、新堯、龍潭、大廠、雄州等）之間也各有1條以上軌道交通線連通；三大新市區内部都将布設軌道交通線路。同年8月，地鐵2号線一期工程經中華人民共和國國務院總理辦公會批準立項。同年9月，完成了《南京地鐵二号線一期工程可行性研究報告》的編制工作。
2003年，南京軌道交通線網在2002年編制的《南京城市軌道交通線網規劃》的基礎上進行了局部調整。調整後，南京都市發展區共13條軌道線路，總長度433千米。其中9條地鐵線（含4條過江線），4條輕軌線，線路總長度433千米。線網密度0.15千米/平方千米。南京主城區共8條地鐵線路，總長度200千米。調整後的遠景線網可基本劃分為兩個層次：即由骨幹線路組成的骨幹網絡和由其他線路組成的預留發展網絡。骨幹網絡共有8條主要線路，由一、二、三、四、五、六号線和江北輕軌、南城輕軌所構成。該骨幹網絡建成後軌道交通将承擔城市客運交通的骨幹作用，同時該網絡也确定為南京城市軌道交通線網規劃的遠期網絡；1月，南京地鐵2号線一期工程通過了中國國際工程咨詢公司組織的專家評審；12月，南京奧體中心附近的向興路站（現名奧體東站）開始動樁施工，标志着規劃已久的二号線試驗段的開工。
2005年5月15日，南京地鐵1号線開通觀光運營；9月3日，正式通車運營。南京地鐵1号線的開通，使南京成為繼北京、天津、上海、廣州、深圳之後，中國内地第6個擁有地鐵的城市。12月31日，《南京市城市快速軌道交通建設規劃（2004-2015）》通過國務院審批，2号線、1号線南延線、2号線東延線、2号線西延線、3号線正式立項。
2006年5月，南京地鐵2号線全面開工。
2007年上半年，南京地鐵1号線南延線工程全面開工，南京地鐵3号線過江隧道通過專家評審，采用過江隧道形式過江。
2009年6月，南京地鐵3号線通過國家環評，初步确定過江隧道直徑11米，單洞雙線過江；10月，地鐵3号線通過國家發改委審批。
2010年1月10日，南京地鐵3号線暨南京地鐵1号線西延過江線試驗段（即南京地鐵10号線過江段）在南京南站舉行開工典禮，标志着地鐵3号線和地鐵10号線過江段正式開工；5月28日，南京地鐵1号線南延線、南京地鐵2号線正式運營，南京地鐵進入十字交叉準網格運營時代。
2011年12月27日，南京地鐵4号線一期、南京地鐵S1号線工程（試驗段）舉行開工儀式。
2012年6月21日，南京地鐵S8号線一期工程開工儀式在六合區棠城廣場舉行；12月27日，南京地鐵S3号線一期工程試驗段工程進入正式實施階段。
2014年1月，南京地鐵S9号線全面開工；6月1日，原南京地鐵1号線小行至奧體中心四個站點停運并入地鐵10号線；7月1日，南京地鐵10号線、南京地鐵S1号線正式運營，南京地鐵線形成網絡化運營；7月18日，南京地鐵S7号線試驗段開工；8月1日，南京地鐵第一條全線位于長江以北的線路——南京地鐵S8号線正式運營。
2015年4月1日，南京地鐵第二條開通的過江線路——南京地鐵3号線正式運營；5月，《南京市城市軌道交通建設規劃（2015-2020年）》獲國家發改委批複，共有8條地鐵線，包括1号線北延、2号線西延、3号線三期、5号線、6号線、7号線、9号線一期和10号線二期工程，總長度157.2千米；10月19日，《南京市（江北新區）軌道交通近期建設規劃（2016-2020）》環境影響評價第一次公示；10月29日，環境影響評價第二次公示。
2016年4月8日，南京地鐵S7号線全線開工；11月1日，國家發改委批複《關于南京城市軌道交通第二期建設規劃調整方案（2016～2021年）》；12月28日，南京地鐵5号線正式開工。
2017年1月18日，南京地鐵4号線正式運營；5月，南京地鐵1号線北延工程正式開工；9月，南京地鐵2号線西延工程正式開工；11月29日，南京地鐵7号線全線開工；12月6日，南京地鐵S3号線一期正式運營；12月30日，南京地鐵S9号線正式運營，地鐵S9号線的開通運營，使南京成為中國第一個區縣全部開通地鐵的城市，南京地鐵線網覆蓋全市所有的市轄區。
2018年5月26日，南京地鐵S7号線正式運營；11月10日，南京地鐵S8号線南延工程正式開工；12月21日，南京地鐵S6号線正式開工；12月30日，南京地鐵S4号線滁州段正式開工。
2019年12月28日，南京地鐵6号線開工建設。
2020年3月8日，南京地鐵9号線正式開工；6月2日，南京地鐵10号線二期工程正式開工；12月30日，南京地鐵S2号線馬鞍山段正式開工。
2021年2月1日，南京地鐵4号線二期工程正式開工；5月，南京地鐵3号線三期工程正式開工；11月30日，南京地鐵11号線正式開工；12月28日，南京地鐵2号線西延線、南京地鐵S6号線正式運營，地鐵S6号線的開通運營标志着南京地鐵的發展正式跨出南京市域；南京地鐵S2号線南京段、南京地鐵S4号線南京段和南京地鐵S5号線一期工程正式開工。
2022年9月30日11時，南京地鐵S8号線南延線正式運營。
運營情況
運營線路
運營時間
客運流量
南京地鐵1号線于2005年5月15日開通觀光運營，9月3日正式開通運營，南京地鐵在開通首個整年就實現了收支平衡、略有盈餘，一舉打破了地鐵運營虧損的世界性難題。至2012年底，共計完成運營收入24.86億元，收支盈餘2.16億元。
2012年年度報告顯示，南京地鐵日均客流已占全市公交出行量的三分之一，地鐵已成為南京城市交通的骨幹線、主力軍，日均客流量超過110萬人次，全年運送乘客約4億人次。2013年，南京地鐵完成客運量4.52億人次，與2012年相比增長了12.9%。
經統計，地鐵日均客流已從2005年的15.22萬人次，增加到2015年的220萬人次，至2015年7月共計安全運送乘客27.3億人次。南京地鐵2014年的客運總量，占江蘇省地鐵客運總量的73%。2015年，南京地鐵承擔客運人數達7.17億人次，占城市公交客運總量34.8%。2017年，南京地鐵累計客流9.77億人次，日均客流267.7萬人次。2018年，南京地鐵累計客流11.125億人次，日均客流304.79萬人次。2019年，南京地鐵累計客流12.78億人次，日均客流350萬人次。
伴随着地鐵線路的延伸和市民對地鐵的信賴，地鐵單日客流紀錄不斷刷新，2020年12月31日達到421.9萬人次，創運營以來單日客流新高。
管理規章
南京地鐵執法基礎依據的是《南京市軌道交通管理條例》，南京地鐵執法單位是南京市公安局地鐵分局，另外南京地鐵運營分公司也有部分執法權。
《南京市軌道交通管理條例》已由南京市第十四屆人民代表大會常務委員會第四次會議于2008年7月31日制定，江蘇省第十一屆人民代表大會常務委員會第五次會議于2008年9月28日批準，現予公布，自2009年1月1日起施行。
2014年7月1日，修訂一新的《南京市軌道交通條例》正式生效。南京新規實行後，特别加大了對車廂飲食的查處，在實際執行中以勸導制止為主，對于明知故犯、對其他乘客影響較大的行為及時開出罰單。
設備設施
車輛設施
南京地鐵1号線、2号線及10号線全部由一列6節編組車廂的A型列車負責商業客運運營，地鐵3号線由一列6節編組車廂的A型鼓型列車來執行商業客運運營，地鐵4号線、S1号線、S3号線均采用6節B型鼓型列車，地鐵S8号線采用4節編組B型鼓型列車，地鐵S9号線采用3節編組B型鼓型列車進行客運運營。
南京地鐵列車全部采用架空接觸網，由列車受電弓在接觸網上滑行接觸受電，鋼輪鋼軌制式，軌距1.435米，其中1、2、4、10号線由南京浦鎮車輛有限公司和法國阿爾斯通公司聯合制造，3号線由南京浦鎮車輛有限公司、新譽集團、龐巴迪運輸瑞典有限公司聯合制造，S1、S3、S8、S9号線均由南京浦鎮車輛有限公司自主制造。
運行系統
2号線列車和線路安裝了由西門子交通集團和中國電子科技集團公司第十四研究所合作提供的TrainguardMT列車自動控制系統。該系統采用無線通信方式在軌旁和車輛之間連續傳輸數據，通過移動閉塞原理确保列車的穩定運行，以及控制列車的發車間隔。此外，2号線控制中心采用了了西門子交通集團的VicosOC501系統和SicasECC計算機聯鎖系統。地鐵S8号線是南京地鐵首次采用國産化的信号系統。
閘機種類
門式扇形收縮開合閘機進站單程票或者是金陵通卡照感應區打開扇形閘闆進站，出站投入單程票或者用金陵通卡照感應區打開扇形閘闆出站。移動支付過閘在中部為橙黃色的閘機上通過，在傳統刷卡區刷卡；使用支付寶的乘客在閘機橙黃色區域掃碼通過。
乘坐導引
導引标識
南京地鐵導向标識系統采用簡單明了的圖形符号和編号系統，所有車站的标識包括導向标識、位置标識、綜合信息标識、安全标識、無障礙标識等，每個标識種類均采用統一的圖形符号、文字、數字形狀、顔色等，并結合乘客的心理及視覺要求、車站空間的布局進行科學設計，滿足了乘客乘坐地鐵的主要功能需求。
南京地鐵導向标識系統從各個車站出入口500米（部分區域擴展到1000米）範圍的主要街道路口設置了醒目的站外行人指示牌（PDS），給乘客指明了離最近地鐵車站的方向；在每個出入口均設置了南京地鐵LOGO标識及車站站名牌；進入車站後在通道及站廳内對于引導乘車、問訊、購票、進站、乘車方向、地鐵線路圖等均明确設置；站台上設有PIS屏和LED顯示列車到站時間；上車後車廂兩端有IDU屏，配合車輛廣播一起發布到站信息；到達車站站台後每個樓扶梯口均設有出站導向牌；站廳每個出入口處還設置了車站街道圖及公交換乘信息。
票務指南
車票價格
南京地鐵票制按裡程計價，起步價2元可乘4千米，4千米以上部分，票價每增加1元晉級相應裡程。每個自然月份内，普通成人持儲值卡乘坐地鐵，消費累計金額在150元以下的乘次，給予基本票價9.5折優惠；超過150元之後的乘次，給予基本票價9折優惠；超過200元之後的乘次，給予基本票價8折優惠；超過300元之後的乘次，恢複基本票價9.5折優惠，公共交通換乘優惠由1元/人次優惠增加到1.6元/人次。詳細票價查詢可訪問南京地鐵官網。
2019年3月31日之前南京地鐵實行低票價策略，從首條線路正式運營起南京地鐵票價為中國最低，按國際地鐵協會統計的購買力衡量，南京地鐵票價屬亞洲最低，按乘距衡量票價在全球排名末位。
車票種類
單程票：外觀圓形，面值與購買價格相對應，單次乘坐進閘機生效，到達目的地站後出閘機後回收。
金陵通卡：具有儲值功能，沒有最低金額限制，上不封頂，刷卡成人九五折未成年人對折。根據優惠政策，使用金陵通卡乘坐地鐵後，90分鐘之内換乘其他交通工具，或其他交通工具換乘地鐵，有1元優惠。
紙質車票：是指南京地鐵出現大客流時，采用人工售票、人工檢票驗票所使用固定面額的紙質的車票。
限期計次卡：是南京地鐵每逢節假日或者南京地鐵運營紀念日發行的一定面值的儲值卡，限制在一定的日期前使用完，并且每次乘坐不分乘坐裡程長短一律2元或者3元。
乘坐南京地鐵可使用單程票或金陵通，使用金陵通的乘客将獲得9.5折的優惠，使用金陵通學生卡乘客将獲得5折的優惠。
全部車票有效時間均為300分鐘，若300分鐘後仍未出站，則需補交線網最高票價（金牛湖站-高淳站15元）。
全國交通一卡通：2016年7月26日起，南京地鐵支持全國交通一卡通。
互聯互通
2019年12月25日，長三角将在全國軌道交通二維碼範圍内率先實現區域城軌二維碼“互聯互通”服務的全覆蓋。“滬杭甬溫合甯蘇錫徐常”10城居民去對方城市時，隻需打開自己所在城市的地鐵官方APP使用二維碼，在另外9城也能掃碼坐車。
2022年6月28日起，南京地鐵與廣州地鐵乘車二維碼實現互聯互通。
換乘站點
文化特色
地鐵标志
南京地鐵标志以一朵梅花為主體元素，梅花既是南京的市花也是南京城市精神的象征。整體為紅色，代表熱情與繁榮，中間是形似列車車頭的變形的字母“M”，M則是地鐵“Metro”的第一個字母，“M”出頭一點又意喻着漢字“市”的變體，表示着紀念20世紀30年代風靡南京的南京第一條軌道交通“京市鐵路”。
卡通形象
小檔案
名稱：地鐵俠（MetroHero）
昵稱：小飛
性别：男性
身高：130cm
體重：25kg
特長：擁有超能力
喜歡：幫助别人，看大片，探索未知，聽音樂。模仿各種武林高手，期望能夠行俠仗義！
個性：超凡脫俗，善良，勇擔責任，有品位，時尚，值得信賴的朋友。超越了地域和文化的限制。
口頭禅：“有我在，請放心！”
形象介紹
南京地鐵卡通形象是中國首個地鐵的卡通形象，為3D機器人造型，全身以南京地鐵一号線的藍色為主色調，流線型設計和具有金屬感的外觀，彰顯出地鐵科技感和現代化的行業屬性。藍色眼睛、藍白色铠甲、别着天線的圓腦袋，表情很酷。南京地鐵相關負責人表示，他們希望通過“地鐵俠”這一卡通形象代言人，更好地展現南京地鐵“可親可敬、有擔當、負責任”的良好企業公民形象，傳遞人文關懷，履行服務承諾。
南京地鐵作為公交服務企業，吉祥物的命名除了要傳遞人文地鐵品牌價值，同時還要代表南京城市特色和文化内涵。“俠”是中國傳統文化中最具正面積極聯想的價值符号，包含正義、幫助、關愛、責任。南京地鐵是公共服務企業，有責任有義務去給更多的人關心、關愛和責任。“‘俠’也是強大、勇敢、仗義、守信的化身，代表了南京文化内涵和地鐵服務理念。“地鐵俠”還被賦予了積極的個性化元素，将以超強的能力、勇于擔當和富有俠義精神的個性，傳承并彰顯“承恩施善、德貫全程、敢擔大任、回饋社會”的精神。
藝術文化
南京地鐵于首條線路開通之初創造了“文化車站”的全新概念，是中國首個擁有地鐵文化車站的城市，也是中國首個使用本地書法家書寫站名的城市，并利用南京古都文化和中國傳統文化等對車站進行文化主題的塑造。南京地鐵的部分車站設有主題文化牆，運用雕塑、壁畫、石刻、漆畫、鍛鑄、鑲嵌等衆多藝術形式，展現不同的文化特色主題。
建設規劃
在建線路
拟建線路
總體規劃
截至2020年8月，根據南京市《南京市城市總體規劃（2018-2035）》中軌道交通規劃篇，到2035年南京地鐵線網規劃共計27條線路，總長1030千米。其中，城區幹線17條線路，包括地鐵1号線-17号線；市域快線10條線路，包括S1号線-S9号線，以及暫命名18号線的機場快線。
所獲榮譽
全國之最
南京是中國内地第六個擁有地鐵的城市，南京地鐵的建設者依靠“地鐵精神”，在工作中實現了多項全國之最。（以下數據均截至2010年）
一是綜合造價每千米3.92億元，為國内地鐵建設中綜合造價最低；
二是（2019年3月31日第二次調價之前）在以裡程計算費用的城市地鐵中票價為最低，讓乘客得到實惠；
三是運營用工人數全國最少，每千米用工不超過36人，線網總用工約13000人，降低了運營成本；
四是車站藝術品數量為全國單線最多，藝術品設計富含南京文化古都底蘊，彰顯地鐵文化，雅俗共賞；
五是地鐵資源開發獨樹一幟，運營首年資源收入可達7000多萬元，地鐵運營當年通過資源開發收益補償在不還本付息，不提取折舊的情況下，可實現收支基本平衡；
六是在模拟試運營之日，就實現了地鐵、公交、出租車“一卡通”，這在全國是第一家；
七是在确保工程進度的同時研究解決建設過程中的關鍵技術難題，南京地鐵共完成科研項目21項，已完成11項科研成果鑒定。
榮譽列表
2007年12月，“南京地鐵一号線一期工程”喜獲2007年度國家優質工程銀質獎榮譽稱号，是全國城市軌道交通三個獲獎項目之一，也是迄今為止國内唯一的全線由建設單位整體申報的地鐵獲獎項目。
2008年2月，南京地鐵2007年創建的“人文地鐵”服務品牌在會上獲得中國公共事業行業十大影響力品牌，國内地鐵行業僅此一家。
2008年4月，由國家建設部與中國市政工程協會聯合開展的2007年度全國市政金杯示範工程獎揭曉，“南京地鐵一号線（一期）工程”繼獲得2007年度“國家優質工程”銀質獎後，又榮獲2007年度“中國市政金杯示範工程獎”，并在全國61個獲獎工程中名列第一。
2008年4月16日，南京地鐵建設工程榮獲2007年度市級“工人先鋒号”。
2009年8月，南京地鐵參與編制國家标準“城市軌道交通建設項目管理規範”。
2009年10月20日，南京地鐵參加編制國家标準《城市軌道交通試運營标準》。
2010年2月4日，在南京市政府組織召開的全市安全生産暨消防工作會議中，南京地鐵再次榮獲南京市安全生産先進單位，并首次被評為二等獎。
2010年2月下旬，南京地鐵作為第一單位完成“南京地鐵典型車站模式研究”和“南京地鐵一号線運營風險控制關鍵技術研究”2項成果榮獲2009年度南京市科技進步二等獎，“南京地鐵綜合管理信息化系統”和“軌道交通規劃線網的修建順序研究”2項成果榮獲2009年度南京市科技進步三等獎。此外，南京地鐵作為第二單位與南京市交通規劃研究所有限責任公司聯合完成“軌道交通與地面交通一體化銜接研究”獲得2009年度南京市科技進步三等獎。
2010年3月25日，南京市創建勞動關系和諧企業和工業園區工作領導小組授予地鐵運營分公司“2009年度南京市勞動關系和諧企業”稱号。
2010年3月底，南京地鐵地産項目（仙林青龍地塊項目和油坊橋站上蓋物業項目）獲2010年中國商業地産年會“最具投資價值獎”。
2010年4月21日，南京地鐵運營分公司榮獲首批省級“平安企業”稱号。
2010年7月14日，首屆全國MBA院校“百篇優秀教學案例”頒獎典禮在清華大學舉行。南京地鐵“人文地鐵”品牌戰略案例成為獲獎的95個案例之一。
2010年9月3日，作為南京地鐵運營分公司唯一的内部刊物《地鐵運營》報，在創刊四周年之際，該報獲得了“南京市優秀連續性内部資料性出版物”稱号。
2010年9月初，南京市人力資源和社會保障局授予南京地鐵運營分公司“南京市社會保險費申報繳納誠信單位”稱号。
2013年1月，南京市住建委、市政府新聞辦公室主辦的魅力南京“百佳”城鄉建設成果評選活動結束，南京地鐵以4044票的高分拔得頭籌，獲得南京十佳城市建設項目的榮譽。同時，南京地鐵運營公司還獲得了南京市“十佳供保單位”的稱号。
2013年1月21日，在南京市文化廣電新聞出版局組織的優秀連續性内部資料性出版物評選活動中，《地鐵運營》報榮獲“南京市優秀連續性内部資料性出版物一等獎”。
2013年2月初，在南京地鐵珠江路糖果車站五周歲生日之際，該站獲得江蘇省交通運輸廳評出的“江蘇省城市公交行業十佳服務品牌”稱号。
2013年3月，南京地鐵與南京浦鎮車輛廠聯合承擔的“自主國産化地鐵列車集成設計與制造”項目獲2012年度江蘇省科技進步二等獎。
2013年8月，南京地鐵“地下工程施工安全風險理論與實踐”成果獲得2012年中國岩石力學與工程學會科技進步一等獎。
2014年4月25日，南京市交通運輸局召開2013年南京亞青會運輸保障總結暨青奧會運輸保障動員大會，南京地鐵運營公司榮獲亞青會運輸保障優秀團隊。
2014年5月，南京市人民政府印發了《市政府關于公布2013年度南京名牌産品的通知》，公布了2013年度南京名牌産品名單，其中南京地鐵運營公司城市軌道交通運營服務“人文地鐵”注冊商标被列入服務業産品目錄。
2014年5月，南京市人民政府印發了《市政府關于公布2013年度南京市政府質量獎的通知》，公布了2013年度市質量獎和市長質量獎獲獎企業名單，其中南京地鐵運營有限責任公司被授予2013年度南京市市長質量獎提名獎，成為唯一獲此殊榮的企業。
2014年6月，南京地鐵運營公司榮獲南京市節能工作領導小組頒發的“2013年度南京市節能工作先進單位一等獎”。
2014年9月5日，江蘇省協調勞動關系三方委員會召開省模範勞動關系和諧企業表彰大會，南京地鐵運營公司榮獲“第四次江蘇省模範勞動關系和諧企業”稱号。
2014年9月下旬，南京地鐵珠江路“糖果車站”成功獲得“南京市第四批服務品牌”稱号，“人文地鐵”服務品牌順利通過市文明辦複審。
2015年1月，南京市法制宣傳教育領導小組近日印發《關于表彰全市“六五”普法中期先進集體、先進個人的決定》，南京地鐵集團公司被評為南京市“六五”普法中期先進集體。
2015年1月27日，由人民日報社、新浪網、微博聯合主辦的“新形勢·新常态·新思維——2015移動政務峰會”對2014年優秀政務微博機構及個人進行表彰。南京地鐵官方微博表現優異，成為江蘇地區唯一榮獲“全國十大交通機構微博”稱号的政務微博機構。
2015年1月23日，南京地鐵資源開發公司榮獲由中國交通企業管理協會組織的“2014年全國交通企業管理現代化創新成果一等獎”。
2015年4月，南京地鐵建設有限責任公司三号線城中項目部（現三号線工程管理二處）榮獲2014年度“南京市青年安全生産示範崗”榮譽稱号，受到共青團南京市市委的表彰。
2015年4月28日，《人民日報》官方微博發布《2015年一季度全國政務微博影響力報告》，南京地鐵官方微博再次入選“全國十大交通機構微博”榜單，排在北京地鐵、上海地鐵之後位列第三。
2015年7月上旬，經行業主管部門推薦及交通運輸部審核，确定南京地鐵運營公司為全國城市公共交通領域安全生産風險管理獨家創建示範試點單位。
2016年12月12日，2016年工程建設企業質量管理經驗交流會上，南京地鐵建設有限責任公司負責建設的南京地鐵S1号線工程、南京地鐵S8号線工程同時榮獲“2016-2017年度國家優質工程獎”。
2018年6月3日，“南京至高淳城際軌道南京南站至祿口機場段工程（即南京地鐵S1号線）”項目榮獲中國土木工程詹天佑大獎。
2019年4月22日，南京地鐵建設有限責任公司憑借課題《城市軌道交通智能電氣保護控制系統的研制與應用》獲得中國城市軌道交通協會科技進步獎三等獎榮譽證書。該獎項的獲得，标志着建設公司推行創新發展理念取得階段性成果。
價值意義
南京地鐵1号線的開通，使南京成為繼北京、天津、上海、廣州、深圳之後，中國内地第6個擁有地鐵的城市。南京地鐵緩解了日趨擁擠的城市交通，改變城市客運格局，在鞏固各個重要商圈（如新街口、元通、橋北等）功能地位的同時，提升各個重要地區旅遊景點（如夫子廟、玄武湖、紫金山等）的交通功能。（新華網評）
南京地鐵的建設有利于南京市整體交通結構的完善，對于構建城市公交網絡、緩解市内交通壓力等，都發揮極大的促進作用，有利于城市改造、開發和發展，具有顯著的社會效益、經濟效益和環境效益。（人民網評）
地鐵是生命線，是繁榮線，是城市發展的引導線，也是城市地下的風景線。地鐵就像一條金色的絲帶，所到之處，串起财富，催生商機：地價會上升，物業會升值，人流、物流、資金流聞風而至，對經濟的拉動作用十分明顯。地鐵建設作為在各項基礎建設中起着引導規劃，積聚人流，催生物流，吸引資金流的龍頭工程，将有力地推動南京經濟的發展。（時任南京副市長戴永甯評）
