特性
MHC結構十分複雜，顯示多基因性和多态性。多基因性指複合體由多個緊密相鄰的基因座位所組成，編碼産物具有相同或相似的功能。
經典的Ⅰ類基因和經典的Ⅱ類基因，他們的産物具有抗原提呈功能，豐富多态性，直接參與T細胞的激活和分化，參與調解适應性免疫應答。
免疫功能相關基因，包括傳統的Ⅲ類基因及新近确認的多種基因，無多态性或有限多态性，主要參與調控固有免疫應答。
舉例說明
小鼠的MHC：H-2複合體
n位于小鼠的第17對染色體
n由Ⅰ類、Ⅱ類、Ⅲ類基因組成
nⅠ類和Ⅱ類基因參與免疫應答的遺傳調控
nⅢ類基因編碼補體成分和炎症相關的免疫分子
n通常所說為MHCⅠ類和MHCⅡ類基因
人的MHC：HLA複合體
nHLA基因複合體位于人6p21.31
n由HLAⅠ類、Ⅱ類、Ⅲ類基因組成
nHLA-I類基因集中在遠離着絲點的一端，包括B、C、A三個座位（經典基因）
nHLAII類基因在複合體中位于近着絲點一端，由DP、DQ、DR三個亞區組成（經典基因）
nHLAⅢ類基因包括編碼補體成分的基因和炎症相關基因
研究
1980年的醫學·生理學諾貝爾獎授予了貝納塞拉夫、道賽和史奈爾三位免疫遺傳學家,主要是表彰他們在闡明主要組織相容性基因複體(MHC)結構和功能方面的成就。
