教學科研
南京大學商學院除了提供基本的本科階段教育、碩士研究生教育和博士生教育之外，還提供MBA（工商管理碩士）、EMBA（高級工商管理碩士）、MPACC（會計專業碩士）、EDP（高層管理培訓）以及研究生課程進修班等項目。
南京大學商學院同時設有下列研究機構：（教育部）南京大學長三角經濟社會發展研究中心、（教育部）南京大學經濟轉型和發展研究中心、（文化部）南京大學文化産業研究中心、關百豪國際金融管理研究所、南京大學企業戰略研究所、南京大學國際經濟研究所、南京大學數量經濟研究所、南京大學不動産研究中心、南京大學直銷研究中心和南京大學中國審計研究中心。
社會服務
商學院緻力于發揮智力優勢為社會服務，每年舉辦江蘇發展高層論壇、企業家高層論壇，邀請江蘇地區高層次學者、政府官員、企業家參與，為江蘇省的經濟發展、企業經營提供谘詢，在促進江蘇地區改革開放和社會經濟事業發展方面發揮了重要的作用；開辦研究生課程進修班、高級管理人才培訓班、企業總裁高級研修班等，為企業和政府部門提供人才培訓、管理策劃；與企業建立橫向聯系，承擔了多項科研項目，許多教師還受聘擔任省市及大企業的高級顧問，為江蘇經濟發展出謀劃策，已成為江蘇經濟發展和政府決策的智囊團。
國際交流
商學院緻力于加強與海内外的學術交流和合作，與美國南加州大學、内布拉斯加大學、密蘇裡大學、澳大利亞悉尼大學、澳門科技大學、荷蘭馬斯裡赫特管理學院、英國裡茲大學、愛克色特大學、澳大利亞邦德大學、新加坡國立大學等許多院校建立了穩定的學術交流與合作關系。經常邀請諾貝爾經濟學獎獲得者等國際知名學者和著名跨國企業總裁來院講學或開展合作研究，選派教師到哈佛大學等名校進修，接待境外學生的學習訪問。
1992年經國家教育部批準，赴新加坡開辦MBA班，這是中國高校首次赴海外開辦高層次的學位班，現已舉辦9期。2000年4月經教育部批準，與荷蘭馬斯特裡赫特管理學院合作建立"中荷國際工商管理教育中心。"
