簡介
一個基因如果存在多種等位基因的形式，這種現象就稱為複等位基因（multiple allelism）。任何一個雜合的二倍體個體隻存在複等位基中的二個不同的等位基因。
原因
複等位基因是由基因突變形成的。一個基因可以向不同的方向突變，于是就形成了一個以上的等位基因。
基因突變的可逆性是複等位基因存在的基礎。
應用
研究複等位基因在植物雜交中對遺傳基因的改良作用。
說明
在完全顯性中，顯性基因中純合子和雜合子的表型相同。在不完顯性中雜合子的表型是顯性和隐性兩種純合子的中間狀态。這是由于雜合子中的一個基因無功能，而另一個基因存在劑量效應所緻。完全顯性中雜合體的表型是兼有顯隐兩種純合子的表型。此是由于雜合子中一對等位基因都得到表達所緻。
比如決定人類ABO血型系統四種血型的基因IA、IB、i，每個人隻能有這三個等位基因中的任意兩個。
舉例
（1） 人的ABO血型
人的ABO學型是由3個複等位基因決定的，即同一等位基因點上有A,B,O三種基因中的任一種。
（2） ABO或ABH系統的生物化學
在紅細胞膜表面，ABO抗原的基本結構是由脂肪酸分子和可變的糖組成的。前體物半乳糖。結合上岩藻糖就成了所謂的H物質，他存在于正常O型血人的紅細胞表面。H物質形成是由一對等位基因H和h控制的，H指令形成H物質所必需的酶，h則不能指令此酶的生成。隻有形成H物質後，A基因指令産生的酶才能把N-乙酰氨基半乳糖結合到半乳糖，形成A抗原；B基因産生的的酶，才能把半乳糖結合到H物質末端半乳糖上，形成B抗原。如果個體是hh純合子，就不能形成H物質。這樣即使體内有A基因或B基因，由于沒有與之相作用的H物質，于是也就不能生成A抗原或B抗原。
