劇情簡介
西曆2008年7月，因科學過度發展，威力強大的超磁力武器，在戰争中被發動，地軸彎曲，地殼發生大變動，五大洲爆裂，陸地下沉，在一瞬間把一半的地球摧毀！20年後，在殘留的小島上，一直以為在大變動後世上隻餘下他與爺爺相依為命的少年高立，在偶然間，在島上海灘救了有與動物溝通能力的少女羅拉，因為羅拉的爺爺是科學家，所以野心家們便想捕捉羅拉對其作出威脅。來到島上的壞人殺害了高立的爺爺，并捉走了羅拉，因此高立便踏上了拯救羅拉的旅程。
分集劇情
第1話「殘留島」
柯南和爺爺二人生活在「殘留島」上，一天女孩拉娜被沖上岸灘，兩人将她救回家中。追捕拉娜的「因得斯利亞」人趕至，爺爺為救拉娜而被槍傷，拉娜終被擒上水陸飛機。
第2話「旅程」
柯南照顧受傷的爺爺，并從他口中得知了2008年那場破壞地球的戰争，以及生還者在殘留島上的事。爺爺終傷重不治，柯南埋葬了爺爺，踏上尋找拉娜的征途。
第3話「第一個朋友」
受暴風雨阻擋，柯南飄流到另一個荒島，并與島上少年金錫打了起來，結果變成好友。二人計劃潛上「巴拉克」号往「工業島」救出拉娜，但因金錫偷竊食物被發現。
第4話「巴拉克号」
柯南代替金錫受打臀處分而病倒，二人因此留在船上當上雜役，初時金錫滿口怨言，柯南一邊忍受病魔折磨一邊工作，後來金錫知道柯南代他受打，深受感動，照顧倒下了的柯南，二人的友情更進一步。
第5話「工業島」+第6話「戴斯的背叛」
「巴拉克」号終于到達了「工業島」，一登陸，柯南欲捉位當日擄走拉娜及害死爺爺的女子孟絲莉，但被「巴拉克」号船長戴斯制止。另一方面，「工業島」行政局長雷普卡，強迫拉娜道出爺爺拉歐博士之下落。柯南救走拉娜，逃往地下城又被擒回。戴斯船長不滿雷普卡所為，決定背叛「因得斯利亞」并帶走拉娜乘「巴拉克」号返回「海霸」島。
第7話「追蹤」+第8話「逃亡」
巴拉克号在濃霧中成功逃走。雷普卡等人乘水上飛機追截，柯南亦乘機偷走潛入飛機，暗地裡與雷普卡等人尋找拉娜下落。柯南自行遊到巴拉克号，救出拉娜，二人患難中見真情。拉娜突有強烈感應到博士就在沙漠中，二人便往沙漠上走。
第9話「親人之迷‧貝利」+第10話「拉歐博士」
柯南與拉娜在沙漠中遇到風暴，不支暈倒，幸好被貝利先生發現獲救，帶返基地。貝利刻意隐瞞二人下落，并留下他們在基地中工作。飛蛾突然大量出現。地震、海嘯令貝利困于海底，二人努力救出，就在此刻貝利道出其真正身份是拉歐博士(拉娜的爺爺)。博士當年逃走時因被毀容而順帶一直隐姓埋名，其後三人用小船逃生。
第11話「逃亡」+第12話「核心區」
博士帶領二人登上飛碟，折返「工業島」救出戴斯、金錫等人。途中遇上孟斯莉之水上飛機，柯南使計令機墜毀。博士和拉娜成功潛入三角塔内，但生命正受威脅。他們救出很多一直被監禁的囚犯，後來得他們協助下，逃出三角塔，大家便高興地飛返「海哈巴」島。
第13話「海哈巴」
博士預感「工業島」将陸沉，決定折返拯救。拉娜、柯南和金錫乘巴拉克号返回海哈巴島。到達後，戴斯被認出為當時擄走拉娜之人，巴拉克号給炸毀，令他傷心不己。
第14話「島上的一天」
拉娜重返「風車村」工作；而柯南則跟随咖喱叔叔從事養魚工作。金錫因誤捕歐羅飼養的豬而引來事端。
第15話「荒地」+第16話「二人的小屋」
柯南和金錫為了不拖累村民，決定深夜潛入歐羅地盤。拉娜為救二人，不惜将媽媽的鍊項，送給歐羅以作交易。拉娜突發了一個噩夢，似是博士呼喚她似的，令拉娜不安。另一方面，柯南、金錫二人與歐羅結怨。歐羅氣結，決與戴斯合作；助他重修「巴拉克」号。戴斯則要燒死柯南和金錫二人。
第17話「戰鬥」+第18話「槍戰ガンボート」
孟斯莉帶領工業島的軍艦欲進占海哈巴島。歐羅勾結工業島，出賣海哈巴島人民，成功占據整個海哈巴島。歐羅成為島上村長；柯南、拉娜被追捕。拉娜以自己來救柯南被捉上炮艦送往工業島。柯南潛入炮艦，放上炸彈炸毀炮艦，乘機救出拉娜返回島上。
第19話「大海嘯」+第20話「重返工業島」
孟斯莉回想童年及美好地球，漸漸喜歡上海哈巴島。海哈巴突然發生海嘯，士兵與村民們一起逃上山上而逃過大難，結果化敵為友，工業島與海哈巴人共同生活，一同努力。孟斯莉與柯南等駕駛博士留下之飛機返回「工業島」拯救其他人民。途中處處受敵，驚險橫生。
第21話「地下的居民們」+第22話「救出」
孟斯莉與柯南因飛機墜毀而被捕。孟企圖說服雷普卡不果，反被判處死。拉娜等人潛入地下城被追殺。幸得難民洛奇救助脫險。雷普卡利用海水注入地下城，以淹死難民作威脅，拉娜唯有就範。孟斯莉被執行槍斃之時，柯南等人及時出現救走她，孟斯莉馬上帶他們往三角塔救拉娜及其他難民。
第23話「太陽塔」
雷普卡快一步帶拉娜乘飛碟一起潛逃。柯南誓死勇救拉娜，雷普卡與飛碟一起被炸毀。太陽能終經博士引導，再次出現于地球，開始重新生活。
第24話「毒蛾号」
雷普卡原來并未死亡，他盜取三角塔的太陽能，并潛入控制室，成功開動最後的兵器「毒蛾号」，「毒蛾号」乃具毀滅世界能力的飛機。為阻止雷普卡等人，柯南、金錫與泰時偷入「毒蛾号」，決一死戰。
第25話「工業島的末日」
柯南、金錫與戴斯三人冒險潛入「毒蛾号」并與雷普卡作戰，不論雷普卡用盡方法也拿柯南等人沒辦法，反而被三人大肆破壞「毒蛾号」，最後「毒蛾号」被毀滅，雷普卡等人死去，但柯南與金錫戴斯等人在混亂中失散。
第26話「大團圓」
「工業島」即将下沉，博士着令所有居民乘船離去。拉娜憑心靈感應找回柯南，但博士因年紀老邁而離世。大家回到「海哈巴」過着安靜的生活。戴與孟結婚，其後與柯南、金錫、拉娜等返回「殘留島」再開墾居住樂園，回到「殘留島」時，發現因為地殼變動，「殘留島」已經從原來的小島變成了一片新大陸，衆人雀躍不已，為充滿新希望的未來感到高興。
主題歌
片頭曲：「いま、地球が目覚める」（地球如今甦醒了）
片尾曲：「幸せの予感」（幸福的預感）
演唱：鎌田直純・山路ゆう子
題材來源
亞曆山大·凱伊的theincredibletide（日文直譯《大津波》，意譯為《留下的人們》或《被遺棄的人》）.
幕後制作
該作是NHK播映的第一部連續TV動畫，之後推出了同名劇場動畫。1984年3月11日，以TV中人氣最高的三話重新編輯制成的TV特别篇《巨大機GIGANT的複活》播出。
日本一代動畫大師宮崎駿向來善于以溫馨感人、輕松容易的故事情結，述說他對大自然的關心以及環保的理念。風之谷中人類所面臨的威脅，天空之城守護自然的大樹，龍貓與魔女宅急便則以寫實的手法，描述了心中的理想國度。宮崎駿曾說過：動畫是一個如此純真、素樸，又可讓我們貫穿想象力來表現的藝術，它的力量不遜色給詩、小說或戲劇。但其實第一部全程由宮崎駿監制的作品卻是此部作品。
此部動畫中，充滿了宮崎駿式的飛船、機器人、海洋，少年少女之間真誠的友誼情感，在樸實的畫風中，彰顯着人類最純真的一面。宮崎駿對于飛翔的喜愛，幾乎所有作品都脫離不了飛行，不管是風之谷中的飛行器、魔女琦琦的掃把，飛行絕對是宮崎駿電影中最重要的元素。在未來少年科南中也是一樣，宮崎駿設計出許多充滿幻想的船隻、機器人，帶着科南與拉娜展開他們的冒險。
